Laboratório de sequenciamento no Programa Genoma Humano do Câncer

• Processo: 99/03669-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 1999
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2001
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Acordo de Cooperação: Instituto Ludwig
• Pesquisador responsável: Helaine Carrer
• Beneficiário: Helaine Carrer
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Expressão gênica Análise de sequência de DNA Liberação epidérmica de DNA mediada por partículas Genoma Humano do Câncer
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Agrobacterium Tumefasciens | Biolistica | Clonagem De Genes | Expressao Genica | Sequenciamento De Dna | Transformacao De Plantas

Resumo

O projeto de sequenciamento do genoma Humano-Câncer iniciou-se em Junho de 1999, através de um programa de parceria participando o grupo ONSA e o Instituto Ludwig de Pesquisa do Câncer, São Paulo, Brasil. Este projeto envolveu 6 laboratórios Centrais de Sequenciamento, sendo nosso grupo (CM2) ligado ao laboratório de sequenciamento central do Hemocentro-Faculdade de Ciências Médicas - Unicamp, cujo coordenador foi o Prof Dr. Fernando Costa. O grupo CM2 participou no preparo das bibliotecas a partir dos perfis enviados pelo Instituto Ludwig, preparo de amostras para sequenciamento como também participou da análise computacional das sequências de DNA. Este projeto teve como objetivo inicial o sequenciamento de 500.000 ORESTES e durante o decorrer do projeto houve uma expansão dos objetivos iniciais passando para seqüenciar e analisar 1 milhão de sequencias. Os fragmentos de cDNAs gerados no projeto estão preferencialmente na região codificadora central dos genes humanos expressos a partir de células diagnosticadas com a doença do câncer. Estes fragmentos denominados ORESTES (Open Reading Frame ESTs) foram gerados através da estratégia desenvolvida e patenteada pelo Instituto Ludwig de pesquisa do Câncer-Brasil. O projeto contribuiu com um grande número de sequencias dando suporte à formação de um banco de dados sobre genes humanos envolvidos com a doença, possibilitando a continuidade das pesquisas na área através do Projeto Clínico do Câncer que será iniciado num futuro próximo. (AU)