SucEST - the sugarcane EST project

• Processo: 99/02869-5
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 1999
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2002
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Maria Luísa Penteado Natividade Targon
• Beneficiário: Maria Luísa Penteado Natividade Targon
• Instituição Sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 00/02807-9 - Genoma da cana-de-açúcar, BP.TT
• Assunto(s): Análise de sequência de DNA DNA complementar Cana-de-açúcar Genoma Cana-de-Açúcar - SucEST
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cana-De-Acucar | Cdna | Sequenciamento

Resumo

O Laboratório de Biotecnologia do Centro APTA de Citros 'Sylvio Moreira' participou do SUCEST - THE SUGARCANE EST PROJECT como Laboratório de Sequenciamento. Para a realização do projeto foi proposto, inicialmente, que cada laboratório de sequenciamento entregasse no mínimo 4000 sequências por ano com 350 bases com qualidade Phrep Phrap igualou superior a 20. Além dos trabalhos de sequenciamento, o grupo AC, na pessoa da coordenadora, participou do grupo de Categorização. Nos trabalhos de sequenciamento, o grupo submeteu um total de 10464 leituras, sendo 6205 pagáveis. O índice de pagamento foi de 59,30%. O grupo AC participou dos trabalhos de categorização a partir de outubro de 2000. Neste caso, os clusters que não foram classificados automaticamente foram distribuídos entre 16 pessoas para serem classificados manualmente. Foram feitas pelo grupo AC aproximadamente 700 anotações manuais. (AU)