Utilização da metagenômica como ferramenta para a busca de novos produtos naturais microbianos

• Processo: 11/50869-8
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2012
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2014
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
• Pesquisador responsável: Mônica Tallarico Pupo
• Beneficiário: Mônica Tallarico Pupo
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Genética Genômica Metagenômica Produtos naturais Antibacterianos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Metagenomica | Microrganismos | Moleculas Bioativas | Pcr Screening | Produtos Naturais | Screening Fenotipico

Resumo

Este projeto tem como objetivo principal o estabelecimento de uma abordagem ainda pouco explorada na Química de Produtos Naturais no Brasil - a metagenômica - para a obtenção de produtos naturais microbianos, especialmente com atividade antibiótica (antibacteriana e antitumoral), a partir de micro-organismos de solo não-cultiváveis. Essa proposta contempla um dos principais pré-requisitos para a descoberta de novos produtos naturais, que envolve a prospecção em novas fontes de biodiversidade, as quais frequentemente estão associados à nova diversidade química/biológica. Neste contexto, o presente projeto visa o estudo químico de micro-organismos de solo não-cultiváveis, que representam cerca de 99% de toda a microbiota terrestre. Serão usadas abordagens técnicas de biologia molecular, para o estudo do potencial químico/biológico de micro-organismos de solo não-cultiváveis, como a construção de bibliotecas a partir de DNA ambiental e screenings fenotípico, antibacteriano e baseado em homologia a partir de primers para regiões conservadas de genes policetídeos sintases tipo I e II (PKS I e II). O monitoramento do potencial antibiótico dos constituintes químicos produzidos por micro-organismos de solo não-cultiváveis será realizado através de ensaios antimicrobiano e antiparasitário in vitro e de citotoxicidade em células cancerígenas. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CHARLOP-POWERS, ZACHARY; OWEN, JEREMY G.; REDDY, BOOJALA VIJAY B.; TERNEI, MELINDA; GUIMARAES, DENISE O.; DE FRIAS, ULYSSES A.; PUPO, MONICA T.; SEEPE, PRUDY; FENG, ZHIYANG; BRADY, SEAN F.. Global Biogeographic Sampling of Bacterial Secondary Metabolism. eLIFE, v. 4, JAN 19 2015. (11/50869-8)