Implementação de abordagem metabolômica nos estudos de simbiose fungo-planta

• Processo: 11/18233-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Pesquisador Visitante - Internacional
• Data de Início da vigência: 09 de janeiro de 2012
• Data de Término da vigência: 08 de julho de 2012
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
• Pesquisador responsável: Massuo Jorge Kato
• Beneficiário: Massuo Jorge Kato
• Pesquisador visitante: Silas Granato Villas Boas
• Instituição do Pesquisador Visitante: University of Auckland, Nova Zelândia
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 09/51850-9 - Diversidade molecular em Angiospermas basais, AP.BIOEN.TEM
• Assunto(s): Química de produtos naturais Metaboloma Intercâmbio de pesquisadores Colaboração científica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: endofíticos | Metaboloma | policetídeos sintases | simbiose entre fungo e planta | Química de Produtos Naturais

Resumo

Atividade I - Estabelecimento dos protocolos para análise de metabólitos primários desenvolvidos na Nova Zelândia (jan-março/2012) Protocolos para análise de metabólitos primários que foram desenvolvidos pelo grupo do Dr. Silas Villas-Boas serão estabelecidos no IQ/USP. Esses protocolos incluem metodologia para amostragem e "quenching" de amostras biológicas, extração de metabólitos primários e a análise de metabólitos primários por CG-EM e por FPLC-QToF. Atividade II - Seleção de um fungo endofítico e sua planta hospedeira para análise metabolômica (jan-março/2012) Um fungo endofítico que apresente rápido crescimento em meios de cultura juntamente com a sua planta hospedeira livre de fungos endofíticos serão selecionados para estudos metabolômicos. A seleção será feita baseado na reprodutibilidade de cultura do fungo endofítico e da rapidez e facilidade de crescimento tanto do fungo como da planta hospedeira. Atividade III - Análise metabolômica do fungo, planta e fungo+planta por CG-EM e infusão direta no sistema Q-ToF (fev-junho/2012) Três classes de amostras para análises metabolômicas serão obtidas: (1) amostras de fungo endofítico crescido em meio de cultura; (2) amostras da planta hospedeira livre de fungos endofíticos; e (3) amostras da planta hospedeira associada ao fungo endofítico. Metabólitos primários e secundários serão extraídos dessas amostras e serão analisados tanto por CG-EM quanto por infusão direta no Q-ToF. O objetivo desse estudo é determinar qual o efeito metabólico para a planta hospedeira da sua associação com o fungo endofítico. Atividade IV - Curso de metabolômica para pós-graduação (março-junho/2012) Dez anos se passaram desde que a palavra "metaboloma" foi primeiramente usada para se referir ao conjunto de todos os compostos de baixa massa molecular (< 1500 daltons) que são sintetizados ou modificados por uma célula viva ou um organismo. Como consequência, a metabolômica surgiu como uma nova área nas Ciências Biológicas, que se desenvolveu e se popularizou enormemente nos últimos anos. Como para proteômica, as técnicas analíticas baseadas em espectroscopia de massas são essenciais para metabolômica. Muitos diriam que a metabolômica é uma palavra nova para se descrever uma ciência antiga porque ela revive conceitos e estudos clássicos de bioquímica que "caíram de moda" durante a revolução genômica, e também porque a metabolômica se baseia no uso de técnicas analíticas concebidas muito antes do sequenciamento massivo de diversos genomas. Entretanto, a aplicação da metabolômica, quando combinada a informação de sequenciamento genômico ou a qualquer outra abordagem sistêmica (transcriptômica, proteômica ou fluxômica), se torna uma ferramenta única na ciência biológica moderna. Este curso abordará os aspectos mais importantes da análise metabolômica usando espectrometria de massas, desde amostragem e preparação de amostras às técnicas analíticas mais utilizadas no tratamento dos dados. O curso consistirá de aulas teóricas, aulas práticas, seminários e discussões em grupo. (AU)