Busca de genes de interesse agronômico e caracterização da variabilidade alélica em germoplasma de soja

• Processo: 06/60325-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Primeiros Projetos
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2007
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2008
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
• Acordo de Cooperação: CNPq - Programa Primeiros Projetos
• Pesquisador responsável: Regina Helena Geribello Priolli
• Beneficiário: Regina Helena Geribello Priolli
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Variação genética em plantas Plantas cultivadas Soja Germoplasma vegetal Genes de plantas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Coeficiente De Parentesco | Cultivares De Soja | Genes Candidatos | Microssatelites | Variabilidade Funcional | Variabilidade Genetica

Resumo

Este trabalho tem a finalidade de caracterizar 435 cultivares de soja recomendadas para uso em solo brasileiro a partir de genes candidatos e locos SSRs. A etapa inicial envolve a busca em bancos de dados públicos de locos ESTs geradas pelo seqüenciamento genômico. Palavras chave associadas às características de interesse agronômico são utilizadas como alvo para o desenho destes iniciadores. Para os locos SSR genômicos, a busca resulta de trabalhos prévios e análise do polimorfismo em uma amostra das cultivares. Na construção do banco de dados de variabilidade genética, cada cultivar tem após as amplificações, genotipado em sequenciador automático o seu perfil pelos locos. Também são estimados o número de alelos por loco, o tamanho dos alelos, a frequência de cada alelo, os coeficientes de diversidade genética e as distâncias genéticas das cultivares. Com as informações será possível avaliar o germoplasma da soja cultivada no Brasil, a partir locos SSR e genes expressos, o que proporcionará uma aplicação imediata da genômica no melhoramento de plantas. (AU)