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Algoritmos para detecção de Network Motifs

Processo: 13/00836-1
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de maio de 2013
Data de Término da vigência: 30 de abril de 2015
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação
Pesquisador responsável:Luis Augusto Angelotti Meira
Beneficiário:Luis Augusto Angelotti Meira
Instituição Sede: Faculdade de Tecnologia (FT). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Limeira , SP, Brasil
Assunto(s):Redes complexas  Teoria dos grafos  Algoritmos  Biologia computacional 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Algoritmos | bioinformática | grafos | Network Motifs | Redes Complexas | Redes Complexas

Resumo

Network Motifs, ou simplesmente Motifs, são pequenos padrões isomórficos que se repetem dentro de uma Rede Complexa com uma frequência incomumente alta. Pesquisadores de diversas áreas usam motifs como uma ferramenta de análise, em especial, para caracterizar sequências regulatórias dentro de uma cadeia genética. O objetivo principal deste projeto é realizar pesquisas em Network Motifs sob a ótica da Ciência da Computação. O objetivo desta pesquisa é desenvolver algoritmos rápidos que detectam motifs. Os resultados deste projeto também incluem um ferramenta para detecção de motifs que será disponibilizada para pesquisadores de redes complexas. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MEIRA, LUIS A. A.; MAXIMO, VINICIUS R.; FAZENDA, ALVARO L.; DA CONCEICAO, ARLINDO F.. acc-Motif: Accelerated Network Motif Detection. IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, v. 11, n. 5, p. 853-862, . (13/00836-1)