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Análise da expressão gênica de Xylella fastidiosa in planta

Processo: 08/53231-1
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2008
Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2013
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Luiz Roberto Nunes
Beneficiário:Daiene Souza Santos
Instituição Sede: Pró-Reitoria de Pesquisa, Pós-Graduação e Extensão. Universidade de Mogi das Cruzes (UMC). Mogi das Cruzes , SP, Brasil
Assunto(s):Xylella fastidiosa   Genômica   Expressão gênica
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Genomica Funcional | Microarray | Xylella Fastidiosa

Resumo

O projeto se propõe a avaliar a expressão gênica da fitobactéria Xylella fastidiosa, crescida in planta, através da metodologia de hibridação em microarranjos DNA. Para isso, utilizaremos RNA extraído de células recém isoladas do xilema de plantas infectadas. No entanto, uma vez que tais amostras de RNA são extremamente diminutas (tipicamente, menos de 100 ng por extração), pretendemos submetê-las a um protocolo de amplificação linear semelhante àquele adotado para o estudo de expressão gênica em eucariotos. Dessa forma, algumas metodologias alternativas para amplificação de RNA bacteriano serão testadas e avaliadas quanto à sua eficiência e confiabilidade na amplificação do RNA de X. fastidiosa. Um protocolo visando à purificação e amplificação do RNA de células de Xylella fastidiosa recém isoladas do xilema de plantas infectadas será padronizado e o material será utilizado para avaliar a expressão gênica da bactéria in planta com os microarranjos. Finalmente, a variação de expressão de alguns genes será confirmada através de reações de qPCR. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ALENCAR, VALQURIA C.; BARBOSA, DEIBS; SANTOS, DAIENE S.; OLIVEIRA, ANA CLAUDIA F.; DE OLIVEIRA, REGINA C.; NUNES, LUIZ R.. Genomic Sequencing of Two Coffee-Infecting Strains of Xylella fastidiosa Isolated from Brazil. GENOME ANNOUNCEMENTS, v. 2, n. 1, p. 2-pg., . (08/53231-1, 09/50115-3, 09/50114-7)
BARBOSA, DEIBS; ALENCAR, VALGUIRIA CAMPOS; SANTOS, DAIENE SOUZA; DE FREITAS OLIVEIRA, ANA CLAUDIA; DE SOUZA, ALESSANDRA A.; COLETTA-FILHO, HELVECIO D.; DE OLIVEIRA, REGINA COSTA; NUNES, LUIZ R.. Comparative genomic analysis of coffee-infecting Xylella fastidiosa strains isolated from Brazil. MICROBIOLOGY-SGM, v. 161, n. 5, p. 1018-1033, . (09/50114-7, 08/53231-1, 09/50115-3)
BARBOSA, DEIBS; ALENCAR, VALGUIRIA CAMPOS; SANTOS, DAIENE SOUZA; DE FREITAS OLIVEIRA, ANA CLAUDIA; DE SOUZA, ALESSANDRA A.; COLETTA-FILHO, HELVECIO D.; DE OLIVEIRA, REGINA COSTA; NUNES, LUIZ R.. Comparative genomic analysis of coffee-infecting Xylella fastidiosa strains isolated from Brazil. MICROBIOLOGY-SGM, v. 161, p. 16-pg., . (08/53231-1, 09/50115-3, 09/50114-7)