Filogenia molecular de cianobactérias baseada em sequências do 16S-23S ITS e pc-igs: investigação de transferência lateral do PC

• Processo: 08/56534-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2009
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2011
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Botânica - Taxonomia Vegetal
• Pesquisador responsável: Maria Do Carmo Bittencourt de Oliveira
• Beneficiário: Viviane Piccin dos Santos
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Diversidade genética Cylindrospermopsis
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cyanobacteria | Cylindrospermopsis | Diversidade Genetica | Filogenia Molecular | Geitlerinema | Taxonomia

Resumo

As cianobactérias apresentam grande variabilidade fenotípica e de habitats. O uso de técnicas moleculares tem elucidado vários problemas de taxonomia e filogenia dentro do grupo. Para estudos em nível infragenérico, os loci 16S-23S ITS e PC-IGS são indicados e têm sido amplamente utilizados. Apesar disso, resultados baseados em diferentes loci podem apresentar diferenças significativas e há indícios de que em alguns casos isso se deva ao envolvimento destes genes em eventos de transferência lateral. Estudos anteriores (Fapesp 04/01749-6) com Geiterinema spp. levantaram tal hipótese que pode ser confirmada no presente estudo. Em paralelo, a espécie Cylindrospermopsis raciborskii apresenta capacidade de adaptação a diferentes condições ambientais e estudos de filogenia molecular auxiliam no entendimento da dispersão e capacidade de invasão desta espécie. Considerando-se a escassez de estudos sobre a diversidade genética de Cylindrospermopsis e Geitlerinema no Brasil e a necessidade de investigação da possibilidade de transferência lateral de genes, o presente projeto tem como objetivos: a) investigar a possibilidade de transferência lateral de genes PC-IGS em Geitlerinema e Cylindrospermopsis; b) inferir a filogenia molecular de linhagens brasileiras C. raciborskii através de 16S-23S ITS e PC-IGS; c) inferir a filogenia molecular de linhagens Geitlerinema spp. através do 16S-23S ITS; d) comparar as filogenias geradas através dos loci 16S-23S ITS e PC-IGS; e) investigar as relações filogenéticas entre populações brasileiras de C. raciborskii e Geitlerinema sp. com outras disponíveis no GeneBank; f) contribuir para o conhecimento da diversidade genética de cianobactérias de regiões tropicais. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LORENZI, ADRIANA STURION; CHIA, MATHIAS AHII; PICCIN-SANTOS, VIVIANE; BITTENCOURT-OLIVEIRA, MARIA DO CARMO. Microcystins and cylindrospermopsins molecular markers for the detection of toxic cyanobacteria: a case study of northeastern Brazilian reservoirs. LIMNETICA, v. 34, n. 2, p. 269-281, DEC 2015. (13/11306-3, 08/56534-5, 14/01913-2)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SANTOS, Viviane Piccin dos. Filogenia molecular de cianobactérias baseada em sequências do 16S-23S-ITS rDNA e PC-IGS: investigação de transferência lateral do PC. 2011. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Instituto de Biociências. Rio Claro Rio Claro.