Artizima-ferramenta computacional para evolução in silico de enzimas utilizadas em biorrefinarias.

• Processo: 09/08386-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2009
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2009
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Sistemas de Computação
• Pesquisador responsável: Renato Luis Tame Parreira
• Beneficiário: Fernando Aurélio Martins Muniz
• Vinculado ao auxílio: 07/59308-3 - Artizima - ferramenta computacional para evolução in silico de enzimas utilizadas em biorefinarias, AP.PIPE
• Assunto(s): Enzimas Biologia computacional Simulação de dinâmica molecular Biorrefinarias Biotecnologia Inteligência artificial
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Biorefinaria | biotecnologia | enzimas | Inteligência Artificial | simulação molecular | Inteligência Artificial

Resumo

Em termos técnicos e práticos, o projeto ARTIZIMA possui um caráter interdisciplinar, relacionado às frentes de biotecnologia e bioinformática. A frente de biotecnologia já foi executada no laboratório do Prof. Dr. Richard John Ward, onde seu grupo conseguiu selecionar 23 enzimas xilanases mutantes. A frente te bioinformática será executada nesse projeto, o qual prevê a utilização de simulações moleculares com relativa complexidade, em função do aumento gradual de temperatura que a enzima deverá ser exposta. As simulações contribuirão para funções de fitness mais efetivas que serão avaliadas e desenvolvidas em acordo com as estratégias evolutivas a serem adotadas. Desse modo, o pacote de simulação de Dinâmica Molecular será utilizado como módulo de simulação molecular, seu código será modificado na construção da ferramenta para se tornar automatizado, prevendo o sistemático aumento de temperatura. Parte da função de fitness será sempre obtida após um acréscimo na temperatura, de modo que um relatório será emitido, possibilitando o acompanhamento da mesma.