Estudo e aplicação de medidas de similaridade semântica como auxiliares na visualização das interações gênicas na Esquizofrenia

• Processo: 11/08697-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2011
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2012
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
• Pesquisador responsável: Evandro Eduardo Seron Ruiz
• Beneficiário: Lulu Wu
• Instituição Sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Teoria dos grafos Biologia computacional Redes complexas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Doenças Complexas | Redes Complexas | Redes Gênicas | similaridade semântica | teoria dos grafos | Bioinformática

Resumo

O estudo das doenças crônicas de causas genéticas atualmente passa pelo estudo das relações entre os possíveis genes causadores destas doenças. Neste projeto avaliaremos os genes candidatos a pertencerem ao conjunto de genes responsáveis pelas manifestações de sinais e sintomas da Esquizofrenia. Neste projeto, pretendemos utilizar como medida de relacionamento entre genes medidas de similaridade semântica entre os termos da Gene Ontology, anotados para cada gene. Duas medidas serão utilizadas: a medida proposta por Resnik e a medida proposta por Lin. Pretendemos também elaborar um serviço web que ilustra numa projeção bi-dimensional as distâncias relativas entre os genes submetidos ao site. Os resultados deste estudo permitirão aos usuários do site visulizar as interações gênicas entre os gene de uma lista relativamente à semântica dos processos biológicos anotados para estes genes.