| Processo: | 12/22205-0 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Iniciação Científica |
| Data de Início da vigência: | 01 de fevereiro de 2013 |
| Data de Término da vigência: | 31 de janeiro de 2014 |
| Área de conhecimento: | Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Sistemas de Computação |
| Pesquisador responsável: | Carlos Norberto Fischer |
| Beneficiário: | Victor de Abreu Campos |
| Instituição Sede: | Instituto de Geociências e Ciências Exatas (IGCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil |
| Assunto(s): | Biologia computacional Elementos de DNA transponíveis Modelo oculto de Markov |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Elementos transponíveis | Identificação e Classificação | Modelos Ocultos de Markov | Bioinformática |
Resumo SATEComp é um ambiente computacional voltado para auxiliar processos de análise de Elementos Transponíveis (TEs). O SATEComp identifica e classifica TEs em sequências genômicas através do processo de homologia (usando o aplicativo RepeatMasker) e utilizando Modelos Ocultos de Markov (HMMs) (usando o aplicativo HMMER). Neste projeto, o aluno buscará formas de melhorar os resultados obtidos atualmente pelo SATEComp, especificamente no que se refere aos resultados produzidos a partir do uso de HMMs. Para isso, ele aprofundará seus conhecimentos sobre os temas TEs e HMMs, visando encontrar alternativas para a geração dos modelos HMM necessários para a identificação e classificação de TEs. | |
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