Influência de elementos móveis em linhagens de Xanthomonas oryzae

• Processo: 12/24954-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2013
• Data de Término da vigência: 01 de janeiro de 2017
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Marie-Anne Van Sluys
• Beneficiário: Paula Cristina Gasperazzo Turrini
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 15/24956-1 - Influência de elementos móveis em linhagens de Xanthomonas oryzae, BE.EP.DR
• Assunto(s): Xanthomonas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: arroz | diversificação de linhagens | ilha genômica XODB | IS elements | Transferência horizontal de genes | Xanthomonas oryzae | Evolução

Resumo

Microorganismos ocupam os mais diversos habitats e exibem uma enorme diversidade metabólica, em estrutura e composição celulares, estilos de vida e nichos ecológicos (Doolittle 1999; Arber 2000). Elementos móveis influenciam fortemente a evolução do grupo Bacteria, uma vez que são integrantes importantes do processo de geração da variabilidade genética e promovem a diversidade da população frente à estocasticidade do ambiente. O projeto descrito propõe a investigação de elementos e processos que potencialmente carregam influências substanciais na história evolutiva em linhagens de Xanthomonas oryzae, os quais refletem em seus genomas a forte influência de elementos de transposição que provavelmente contribuíram em seu processo de diversificação. Nossa primeira frente de investigação tem como objetivo avaliar, num primeiro momento in silico, o possível envolvimento do sistema nativo de reparo na proliferação genômica de transposons do tipo IS no grupo Xanthomonas dada a distribuição dos elementos do tipo IS neste grupo bacteriano. Nossa segunda frente de investigação se refere a um evento particular de transferência horizontal da ilha genômica denominada XODB602, exclusivamente encontrada no patovar Xanthomonas oryzae pv. oryzicola e membros do grupo Rhizobiales. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

NAGEL, RAIMUND; TURRINI, PAULA C. G.; NETT, RYAN S.; LEACH, JAN E.; VERDIER, VALERIE; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; PETERS, REUBEN J.. An operon for production of bioactive gibberellin A(4) phytohormone with wide distribution in the bacterial rice leaf streak pathogen Xanthomonas oryzae pv. oryzicola. NEW PHYTOLOGIST, v. 214, n. 3, p. 7-pg., 2017-05-01. (08/52074-0, 12/24954-0, 15/24956-1)

NAGEL, RAIMUND; TURRINI, PAULA C. G.; NETT, RYAN S.; LEACH, JAN E.; VERDIER, VALERIE; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; PETERS, REUBEN J.. An operon for production of bioactive gibberellin A(4) phytohormone with wide distribution in the bacterial rice leaf streak pathogen Xanthomonas oryzae pv. oryzicola. NEW PHYTOLOGIST, v. 214, n. 3, SI, p. 1260-1266, MAY 2017. (15/24956-1, 12/24954-0, 08/52074-0)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

TURRINI, Paula Cristina Gasperazzo. Influência de elementos genéticos móveis em linhagens de Xanthomonas oryzae.. 2017. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI) São Paulo.