Família Selenastraceae (Chlorococcales): avaliação de potências marcadores moleculares para DNA barcoding e para filogenia dos gêneros Monoraphidium e Ankistrodesmus

• Processo: 13/18083-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2016
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Botânica - Taxonomia Vegetal
• Pesquisador responsável: Armando Augusto Henriques Vieira
• Beneficiário: Inessa Lacativa Bagatini
• Instituição Sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 11/50054-4 - Biodiversidade de microalgas de água doce: banco de germoplasma e obtenção de marcadores moleculares das espécies criopreservadas, AP.BTA.TEM
• Assunto(s): Marcador molecular Algologia Chlorophyceae Código de barras de DNA taxonômico
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Chlorophyceae | DNA barcoding | marcadores moleculares | Selenastraceae | Ficologia

Resumo

A ordem Chlorococales possui grande diversidade morfológica e representa grande parte do fitoplâncton de águas continentais. Dentro dessa ordem, a família Selenastraceae é um dos grupos de algas verdes de maior complexidade para taxonomia morfológica clássica, pois possuem grande plasticidade fenotípica, o que dificulta sua identificação em levantamentos de diversidade fitoplanctônica. Além disso, a análise de sequências do 18S rDNA mostrou que, embora as Selenastraceae sejam um grupo monofilético, as características morfológicas são ambíguas em nível de gênero e não refletem as relações filogenéticas, especialmente em Monoraphidium e Ankistrodesmus. Objetivo deste trabalho é obter uma região que possa ser utilizada como DNA barcode para Selenastraceae, testando 3 regiões possíveis, em princípio: rbcL, tufA, psbA-trnH. Além disso, pretendemos utilizar os marcadores moleculares para, em associação com resultados de outros projetos dentro do projeto temático, elucidar as relações filogenéticas do grupo, especialmente entre as espécies dos gêneros Monoraphidium e Ankistrodesmus. Os marcadores serão amplificados a partir do DNA extraído de culturas unialgais axênicas, utilizando-se primers descritos na literatura ou desenhados a partir de sequências disponíveis em bancos de dados para esse grupo. A determinação de regiões que possam ser utilizadas para DNA barcoding na família Selenastraceae facilitará a identificação das espécies, cujo número é, muito provavelmente, subestimado quando utilizada a classificação morfológica, além disso, o uso de marcadores moleculares pode auxiliar na resolução filogenética do grupo. A presente proposta será a primeira a desenvolver estudos moleculares com cepas brasileiras desse grupo de algas. (AU)

Publicações científicas

(8)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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