Genômica comparativa para estudos de evolução em ciclídeos sul-americanos

• Processo: 13/23465-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2014
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2016
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: César Martins
• Beneficiário: Érica Ramos
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Assunto(s): Genômica Evolução animal Tilápia-do-Nilo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Ciclídeos | Evolução | Genômica | Next-generation sequencing | Genômica

Resumo

Sequenciamentos de última geração (next generation) geram enormes quantidades de dados, em um curto período de tempo e com custo reduzido. Esta quantidade massiva de sequências de DNA abre novas perspectivas de integração a dados citogenéticos para maior resolução de organização estrutural e evolução de genomas, detecção de variações nucleotídicas, identificação de genes ligados a doenças e genômica funcional. Os ciclídeos tem recebido grande interesse científico uma vez que alguns grupos sofreram um rápido e extenso processo de radiação adaptativa, tornando este grupo de peixes um excelente modelo para estudos evolutivos. Para ciclídeos africanos, estudos genômicos e citogenéticos vêm demonstrando uma alta conservação na organização genômica dessas espécies, entretanto abordagens genômicas não tem sido aplicadas para ciclídeos sul-americanos. O cenário citogenético existente para este grupo indica uma variedade muito maior e uma história evolutiva distinta, apesar de ambos os grupos pertencerem à mesma família. Além disso, dados utilizando sequenciamento em larga escala são ainda uma lacuna no conhecimento de ciclídeos neotropicais e, se disponibilizados, podem ser de grande valia para estudos complementares. Desta forma, a presente proposta pretende relacionar dados genômicos a dados citogenéticos de ciclídeos sul-americanos, contribuindo para o entendimento de sua história evolutiva, bem como disponibilizar dados genômicos para futuros estudos destas espécies. A hipótese é de que a maior diversidade cariotípica encontrada nos ciclídeos sul-americanos, em relação aos africanos, provavelmente reflita uma alta diversidade de organização genômica. (AU)