Caracterização dos genes relacionado ao câncer em tecidos normais e construção de um banco de dados

• Processo: 15/10529-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2015
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Pedro Alexandre Favoretto Galante
• Beneficiário: Vanessa Candiotti Buzatto
• Instituição Sede: Hospital Sírio-Libanês. Sociedade Beneficente de Senhoras (SBSHSL). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional DNA de neoplasias Regulação da expressão gênica Genes Plataforma (computação) Organização da informação Banco de dados Análise de sequência de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: banco de dados | expressão gênica | Genes relacionados ao câncer | genômica | modificações pós transcricionais | regulação da expressão gênica | Bioinformática

Resumo

Atualmente, graças as novas plataformas de sequenciamento de DNA e capacidade de análises de genomas tumorais, conhecemos grande parte dos genes relacionado ao processo de aparecimento e manutenção de tumores humanos, tais como TP53, ERBB2, KRAS, APC, RB e PTEN (aqui chamados de "genes de câncer"), entre muitos outros. Estes genes de câncer, quando alterados podem funcionar como oncogenes ou deixar de ter funções de suprimir características tumorais de uma célula. Apesar de já conhecermos muitas das mutações somáticas e expressões aberrantes afetando estes genes, sabemos muito pouco sobre o seu perfil em condições normais. Por exemplo, não sabemos em quais tecidos muitos dos genes de câncer são expressos de maneira constitutiva, quais são suas variações pós transcricionais e seus polimorfismos normalmente encontradas na população humana. Também não temos bons bancos de dados para mostrar estas informações de maneira amigável e integrada. Neste trabalho, estamos propondo obter, organizar e disponibilizar diversas informações, provenientes de condições normais, dos genes de câncer. Iremos construir um banco de dados com uma interface web onde o usuário poderá obter informações dos genes de câncer em pelo menos 16 tecidos normais, suas isoformas de splicing, os seus polimorfismos e frequência alélica em diversas populações, entre outras informações. Acreditamos que esta ferramenta, ainda inédita, será de grande valia para comunidade científica que trabalha na área de câncer.