| Processo: | 15/21433-8 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado Direto |
| Data de Início da vigência: | 01 de fevereiro de 2016 |
| Data de Término da vigência: | 31 de outubro de 2020 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular |
| Pesquisador responsável: | Mário Henrique Bengtson |
| Beneficiário: | Érico Luiz Moreto Lins |
| Instituição Sede: | Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil |
| Vinculado ao auxílio: | 14/21704-9 - Impacto da regulação traducional na diferenciação neuronal, AP.JP |
| Assunto(s): | Genômica Análise de sequência de RNA Proteínas de ligação a RNA Diferenciação neuronal |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | diferenciação neural | Genômica | Proteínas de ligação a RNA | Regulação traducional | Ribosome profiling (perfil ribosomal) | sequenciamento de RNA | controle traducional da expressão genica |
Resumo Durante a diferenciação celular, vários mecanismos bioquímicos são empregados pela célula para garantir que genes sejam expressos no momento e quantidade adequados, modulando corretamente as diversas vias envolvidas neste complexo processo. Um destes mecanismos controla quais mRNAs especificamente e em que taxa serão traduzidos pelos ribossomos e é conhecido como controle traducional da expressão genica. Desde algum tempo se sabe que este mecanismo deve ser fundamental para o funcionamento celular, visto que a expressão proteica apresenta má correlação com a expressão de mRNA. Apesar disto, os diversos fatores que participam deste mecanismo, como ele opera e quais vias regula ainda são pouco compreendidos. No projeto jovem pesquisador proposto, pretendemos entender como a regulação traducional da expressão genica contribui para a diferenciação neuronal de células neuroprogenitoras. Desta forma, queremos entender quais genes e vias são reguladas traducionalmente no processo de diferenciação e quais proteínas/miRNA participam desta regulação. Para chegar a estes objetivos, propomos comparar os níveis globais de expressão gênica de cada mRNA celular (biblioteca de RNAseq) com o nível dos mRNAs correspondentes ligados aos ribossomos (biblioteca de Riboseq), em diferentes pontos da diferenciação neural. Buscaremos encontrar genes cuja taxa de tradução seja modificada durante o processo como forma de regulação (por exemplo, genes cuja expressão de mRNA não mude, mas que a fração ligada ao ribossomo seja alterada durante a diferenciação). Comparações entre as bibliotecas permitirá identificar quais genes são regulados traducionalmente durante o processo de diferenciação. Além disto, a expressão de miRNAs e de proteínas ligantes de RNA serão comparadas entre os mesmos pontos de tempo para sugerir possíveis responsáveis pela regulação. Alterações da eficiência de tradução serão correlacionadas com indução/repressão de miRNAs e de proteínas ligantes de RNA, na criação de hipóteses de regulação. Estas hipóteses serão testadas experimentalmente por meio de inibição destes fatores e verificação da ausência de regulação, além de detecção da interação física entre os mRNA regulados e os mesmos fatores. Por último, usaremos ensaios biológicos e bioinformática para determinar o impacto da regulação no processo de diferenciação. Verificaremos se a interferência com o processo de controle traducional inibe totalmente/parcialmente o processo de diferenciação. Neste projeto propomos gerar as bibliotecas de RNAseq, miRNAseq e Riboseq e confirmar a regulação traducional dos genes encontrados através da comparação entre o RNAseq e Riboseq. (AU) | |
| Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa: | |
| Mais itensMenos itens | |
| TITULO | |
| Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias ( ): | |
| Mais itensMenos itens | |
| VEICULO: TITULO (DATA) | |
| VEICULO: TITULO (DATA) | |