Caracterização dos genes das metaloproteinases de veneno da serpente Bothrops jararaca

• Processo: 16/26151-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 13 de março de 2017
• Data de Término da vigência: 12 de agosto de 2017
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Inácio de Loiola Meirelles Junqueira de Azevedo
• Beneficiário: Vincent Louis Viala
• Supervisor: Juan Calvete
• Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Instituto de Biomedicina de Valencia (IBV), Espanha
• Vinculado à bolsa: 15/03509-7 - Sequenciamento genômico de serpentes brasileiras focado no estudo de toxinas, BP.PD
• Assunto(s): Serpentes Genomas Genômica Evolução molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Caracterização de genes | evolução molecular | Genoma | metaloproteinases de veneno | Sequenciamento de terceira geração | Serpentes | Genômica

Resumo

Poucos estudos de evolução molecular de toxinas de veneno se baseiam em informações genômicas. Um estudo recente em genes de Echis ocellatus mostrou que duplicações, inserções e deleções de introns parecem ser mais importantes do que mutações pontuais randômicas na diversificação de metaloproteinases de veneno de serpentes (SVMP). Sendo assim, propomos neste projeto caracterizar os genes das SVMP de Bothrops jararaca para reconstruir a história evolutiva desta toxina ancestral, presente em todos os Viperídeos. As SVMPs formam uma família diversa e são classificadas de acordo com sua composição modular de domínios. Com base nos domínios e sequências, fica claro que elas fazem parte da família ADAM de proteínas transmembrana. Aparentemente, as SVMPs se originaram do gene da ADAM28. Nossos dados genômicos corroboram esta hipótese e ainda mostram que elas formam uma família multigênica disposta em tandem por um longo e único segmento do genoma. Nossas sequências do tipo short-reads são menores que os longos elementos repetitivos encontrados no genoma, o que impede a montagem do cluster e, portanto, uma visão mais completa deste cluster de genes. Sendo assim, propomos neste projeto (1) obter sequências longas (long-reads) destes genes usando um sequenciador de DNA de terceira geração MinION da Oxford Nanopore Technology, disponível no laboratório do Dr. Calvete e (2) caracterizar e analisar estes dados genômicos novos, juntamente com nossos dados anteriores, com o Dr. Calvete de forma a elaborar hipóteses sobre o surgimento e evolução destes genes.