Aplicação de ferramentas de bioinformática para análise do perfil de metilação do DNA antes e após a cirurgia bariátrica

• Processo: 17/07220-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 20 de setembro de 2017
• Data de Término da vigência: 19 de dezembro de 2017
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Nutrição - Bioquímica da Nutrição
• Pesquisador responsável: Carla Barbosa Nonino
• Beneficiário: Carolina Nicoletti Ferreira Fino
• Supervisor: Ana Belén Crujeiras Martínez
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Universidade de Santiago de Compostela, Santiago (USC), Espanha
• Vinculado à bolsa: 15/18669-0 - Avaliação do padrão de metilação do DNA antes e após derivação gástrica em Y-de-Roux, BP.PD
• Assunto(s): Genômica Biologia computacional DNA Cirurgia bariátrica Obesidade
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bariatric Surgery | bioinformatics | Dna | methylation array | Obesity | Genômica Nutricional

Resumo

A tecnologia de array incorpora um passo de amplificação de todo o genoma após conversão de bisulfito, que é seguido por fragmentação e hibridação da amostra de DNA para oligómeros específicos para metilação. Após o alinhamento, são necessários mais passos de bioinformática para extrair a informação biologicamente significativa. O objetivo deste estudo é desenvolver habilidades e aumentar o conhecimento em bioinformática para melhor interpretação e análise de dados de metilação de array de DNA com pacientes obesos submetidos à cirurgia bariátrica como modelo. Para tanto, utilizaremos o DNA de 40 mulheres, com idades entre 18 e 60 anos, que foram distribuídas em dois grupos: Grupo Cirurgia Bariátrica: composto por 20 pacientes com obesidade grave (IMC> 40kg/m²) e Grupo Controle, consistindo em 20 mulheres com peso normal (IMC entre 18,5 e 24,9 kg/m²). Os pacientes foram submetidos à avaliação nutricional, análise da composição corporal, análise de ingestão alimentar, coleta de sangue periférico para metilação do DNA e análise bioquímica. Após seis meses, todos os procedimentos foram realizados novamente no Grupo Cirurgia Bariátrica. Neste estudo, a análise do array de metilação será realizada por ferramentas bioinformáticas incluindo software específico. (AU)

Publicações científicas

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NICOLETTI, CAROLINA F.; PINHEL, MARCELA S.; NORONHA, NATALIA Y.; JACOME, AMALIA; CRUJEIRAS, ANA B.; BARBOSA NONINO, CARLA. . NUTRITION, v. 70, p. 5-pg., 2020-02-01. (16/05638-1, 15/18669-0, 17/07220-7)

NICOLETTI, CAROLINA F.; PINHEL, MARCELA S.; NORONHA, NATALIA Y.; JACOME, AMALIA; CRUJEIRAS, ANA B.; BARBOSA NONINO, CARLA. . NUTRITION, v. 70, FEB 2020. (17/07220-7, 16/05638-1, 15/18669-0)

NICOLETTI, C. F. .; PINHEL, M. A. S.; NORONHA, N. Y.; DE OLIVEIRA, B. A.; SALGADO JUNIOR, W.; JACOME, A.; DIAZ-LAGARES, A.; CASANUEVA, F.; CRUJEIRAS, A. B.; NONINO, C. B.. . SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, APR 15 2020. (17/07220-7, 16/05638-1, 13/12819-4, 15/18669-0)

NICOLETTI, C. F.; PINHEL, M. A. S.; DIAZ-LAGARES, A.; CASANUEVA, F. F.; JACOME, A.; PINHANELLI, V. C.; DE OLIVEIRA, B. A. P.; CRUJEIRAS, A. B.; NONINO, C. B.. . BMC MEDICAL GENOMICS, v. 12, MAY 27 2019. (17/07220-7, 16/05638-1, 15/18669-0)