Íntrons e inferência filogenética baseada em SSUrDNA de Hyalosphaeniidae (Amoebozoa: Arcellinidae)

• Processo: 17/09882-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2017
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia - Taxonomia dos Grupos Recentes
• Pesquisador responsável: Daniel José Galafasse Lahr
• Beneficiário: Samuel Pereira Junior
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Filogenia Íntrons Diversidade genética
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Arcellinida | Filogenia | introns | Morfologia | SSU rDNA | Evolução de Protistas

Resumo

O principal objetivo desse estudo é a reconstrução da história filogenética de Hyalospheniidae, baseada em SSU rDNA. Anteriormente, as reconstruções mais compreensivas foram baseadas em outro marcador, a Cox1, ou Citocromo c oxidase 1. Assim, nossos objetivos incluem comparar a diversidade genética com a morfológica das espécies estudadas, além de determinar o "ponto de entrada" do íntrons na história filogenética dessa família. A motivação para esse estudo foi a falta de consenso na árvore filogenética de Hyalospheniidae, além da obtenção de novos dados, como os íntrons encontrados nos sequenciamentos em células únicas de organismos dessa família. A importância do estudo se dá na possibilidade de esclarecer o papel de íntrons na resolução de árvores filogenéticas, utilizando essa família de Arcellinida como modelo. Nós possuímos atualmente de 41 SSUs sequenciadas de Hyalospheniidae e 139 imagens das amostras. O sequenciamento foi feito utilizando células únicas, permitindo dados moleculares com maior veracidade. Os próximos passos do estudo incluem a reconstrução filogenética utilizando esses novos dados, seguida pela análise morfométrica e posteriormente pela análise das distâncias genéticas. Tais procedimentos serão efetuados seguindo protocolos bem estabelecidos no Laboratório de Protistologia Evolutiva. (AU)