Identificação de genes de resistência antimicrobiana em bases de dados metagenômicos

• Processo: 18/21160-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2018
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: María Eugenia Guazzaroni
• Beneficiário: Felipe Marcelo Pereira dos Santos
• Instituição Sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 15/04309-1 - Novas abordagens para melhorar a prospecção funcional de biocatalizadores em bibliotecas metagenômicas, AP.JP
• Assunto(s): Biologia computacional Resistência microbiana a medicamentos Antibióticos Metagenômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Antibióticos | bioinformática | genes de resistência | metagenômica | resistencia antimicrobiana | resistoma | Bioinformatica e metagenômica

Resumo

Os mecanismos de resistência antimicrobiana têm ameaçado a supervivência humana pela ampla distribuição de genes de resistência em microrganismos patógenos que apresentam relação critica nos sistemas de saúde. Um dos mecanismos que promovem esta resistência bacteriana, é o conjunto de genes presentes nos genomas microbianos (cromossômico ou plasmidial) que provêm resistência à um determinado antibiótico. A este conjunto de genes, se dá o nome de resistoma (Crofts et al., 2018). Os estudos dos resistomas foram aprofundados com o surgimento de técnicas ômicas como a Metagenômica, que permite avaliar amplamente o conjunto dos genomas de amostras ambientais e mensurar os mecanismos genéticos distribuídos entre os diferentes componentes das comunidades microbianas (McArthur and Wright 2014). Os microrganismos presentes nesses ambientes são, em sua grande maioria, ainda não cultiváveis e consequentemente desconhecidos. A metagenômica apresenta-se como uma ferramenta importante, já que acessa ao potencial bioquímico dos microrganismos de uma dada amostra ambiental pela extração do seu DNA total, permitindo identificar genes de interesse por abordagem de sequência ou funcional (Guazzaroni et al., 2015). Portanto, ao explorar a diversidade do resistoma, seria possível classificar os elementos gênicos de resistência antimicrobiana, procurando elucidar novos mecanismos de resistência, identificar novos microrganismos que apresentam estes mecanismos, e avaliar a sua distribuição nos ambientes de ecossistemas brasileiros. Assim, o presente projeto visa estudar a compreensão da dispersão de genes relacionados a resistência a antibióticos de diferentes biomas brasileiros.