Metafundadores para predição genômica na raça Montana

• Processo: 19/05516-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 10 de junho de 2019
• Data de Término da vigência: 09 de março de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Fernando Sebastián Baldi Rey
• Beneficiário: Sabrina Kluska
• Supervisor: Daniela Andressa Lino Lourenço
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Georgia, Athens (UGA), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 17/21573-0 - Avaliação genômica em bovinos compostos da raça Montana utilizando dados reais e simulados, aplicando o método do passo único genômico BLUP, BP.DR
• Assunto(s): Avaliação genética animal Predição de genes Melhoramento genético animal Parâmetros genéticos Montana
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: genomic evaluation | metafounders | multi-breed | ssGBLUP | Melhoramento dos Animais Domésticos

Resumo

A busca por metodologias capazes de aumentar a precisão da avaliação genética é constante. No entanto, para populações multirraciais, poucos são os estudos que usam o ssGBLUP e abordagens específicas para essas populações. O objetivo deste projeto de pesquisa é avaliar o impacto do uso de metafundadores na estimação de parâmetros genéticos, valores genéticos genômicos (GEBV), viés e acurácia do GEBV para populações multirraciais e método ssGBLUP. A base de dados é composta por informações fenotípicas de 514.165 animais de raça pura, cruzamentos e animais compostos (Montana). As características de peso ao nascimento(PN), peso à desmama (PD), ganho de peso pós-desmame (GPD) e circunferência escrotal aos 12 meses de idade (CE12)serão utilizadas. Um total de 1.899 animais foram genotipados usando três painéis diferentes com 30, 35 ou 770 mil marcadores SNPs. Posteriormente, todos esses genótipos foram imputados a um painel comercial Profiler (GGP) GeneSeek® da Illumina, contendo aproximadamente 30.000 marcadores SNPs. Análises de uni-características para todas as características descritas acima serão realizadas. Os métodos BLUP, ssGBLUP (BLUP de etapa única) e ssGBLUP + MFS (BLUP de etapa única + metafundadores) serão executados e, em seguida, esses modelos serão comparados entre si. Os resultados deste estudo devem mostrar as vantagens do uso de metafundadores, bem como a implementação do ssGBLUP em uma avaliação multirracial, a fim de aumentar a precisão das avaliações genéticas. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

KLUSKA, SABRINA; MASUDA, YUTAKA; STERMAN FERRAZ, JOSE BENTO; TSURUTA, SHOGO; ELER, JOANIR PEREIRA; BALDI, FERNANDO; LOURENCO, DANIELA. Metafounders May Reduce Bias in Composite Cattle Genomic Predictions. FRONTIERS IN GENETICS, v. 12, AUG 20 2021. (19/05516-1)