Investigação dos mecanismos de patogenicidade de Streptomyces spp. associadas à sarna da batata por análises de genoma e transcriptoma

• Processo: 19/08379-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2019
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2022
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Pesquisador responsável: Suzete Aparecida Lanza Destéfano
• Beneficiário: Mariana Ferreira Tonin
• Instituição Sede: Instituto Biológico (IB). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/50334-3 - Plano de Desenvolvimento Institucional em Pesquisa (PDIp): modernização e adequação de unidades multiusuárias estratégicas do Instituto Biológico, AP.PDIP
• Assunto(s): Bactérias fitopatogênicas Análise de sequência de RNA Expressão gênica Interação planta-patógeno
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Borrelidina | Concanamicina | expressão gênica | Interação planta-patógeno | Pathogenicity Island (PAI) | RNA-seq | Bactérias fitopatogênicas

Resumo

A batata é uma cultura de grande importância econômica, representando o terceiro principal cultivo destinado à alimentação humana, após o arroz e trigo. Devido às suas características nutricionais a batata é um dos vegetais mais importantes na dieta alimentar de vários países e é considerada a segunda maior fonte de nutrientes para a humanidade. Porém, apesar do aumento crescente na produção, a produtividade ainda é considerada baixa devido às pragas e doenças que afetam a cultura. Dentre elas, destaca-se a sarna da batata causada por diferentes espécies de bactérias do gênero Streptomyces. Esta doença afeta as partes subterrâneas da planta, principalmente os tubérculos; apresenta ocorrência generalizada nas regiões produtoras do Brasil e vem aumentando consideravelmente, tornando-se um fator limitante na produção da batata no país. Os sintomas se caracterizam por lesões que podem tomar toda a superfície do tubérculo ou necroses profundas, acarretando diminuição do seu valor comercial e até mesmo impedindo a sua comercialização. Diferentes estudos demonstraram correlação entre a patogenicidade de Streptomyces sp. e a presença dos genes de patogenicidade nec1, tomA e txtAB, que são compartilhados por transferência horizontal e encontram-se em uma região do cromossomo chamada ilha de patogenicidade (PAI - Pathogenicity Island), região que possui genes responsáveis pela ligação do patógeno ao hospedeiro, penetração, colonização e evasão do sistema de defesa da planta. Porém, nem sempre a patogenicidade pode ser correlacionada com a presença destes genes, indicando que, outras vias de patogenicidade também devem estar envolvidas no processo. Diante do exposto, o presente projeto tem por objetivo a análise de genoma e transcriptoma de Streptomyces spp. visando identificar os genes ou regiões ainda desconhecidas envolvidas no mecanismo de patogenicidade destes fitopatógenos.