Abordagem sistêmica da cana de açúcar: entendendo a expressão gênica para melhorar o crescimento e produção de bioetanol

• Processo: 21/08334-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2021
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2023
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Acordo de Cooperação: CNPq - INCTs
• Pesquisador responsável: Marcos Silveira Buckeridge
• Beneficiário: Mauro de Medeiros Oliveira
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/50884-5 - INCT 2014: Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol, AP.TEM
• Assunto(s): Biologia computacional Proteômica Transcriptoma Expressão gênica Parede celular Cana-de-açúcar Análise de dados Banco de dados
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Análise de Dados | Banco de dados | Parede celular | proteômica | Transcriptoma | Bioinformática

Resumo

O projeto de pesquisa INCT-Bioetanol tem como um dos objetivos explorar o potencial de alvos relacionados às modificações de parede celular e de rotas sinalizadoras de açúcares a fim de aumentar a produção de biomassa para bioenergia. Contudo, eventos espontâneos de poliploidização no gênero Saccharum tornaram o genoma de cana-de-açúcar redundante, abrigando genes em várias cópias funcionais. Adicionalmente, as cultivares de cana-de-açúcar são híbridos interespecíficos poliploides/aneuplóides, o que confere uma complexidade ao genoma, tornando estudos moleculares nesta espécie um desafio. Atualmente, o grupo de pesquisa LAFIECO possui três bancos de transcriptoma, um proteoma e um microtranscriptoma. Além disso, duas ferramentas para análise sistêmica de redes foram desenvolvidas. Desta forma, pretende-se desenvolver um banco de dados local para armazenamento e divulgação dos resultados obtidos, os quais poderão ser facilmente acessados e utilizados em estudos posteriores, além de se estruturar a integração das ferramentas de análise de redes. (AU)