Relações filogenéticas entre gêneros e famílias de Siluriformes usando elementos ultraconservados

• Processo: 21/12979-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2022
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia
• Pesquisador responsável: Claudio de Oliveira
• Beneficiário: GABRIEL DE SOUZA DA COSTA E SILVA
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 20/13433-6 - Filogenia e identificação molecular de peixes da superordem Ostariophysi (Chordata: Actinopterygii) utilizando abordagens genômicas, AP.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 22/13025-0 - Filogenia molecular de Siluroidei utilizando os elementos ultraconservados, BE.EP.PD
• Assunto(s): Sistemática Peixes Filogenia Siluriformes Ostariophysi Sequenciamento completo do genoma DNA mitocondrial Biogeografia Biodiversidade
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biodiversidade | Biogeografia | Evolução | Peixes | Sistematica | Taxonomia | Sistemática de peixes

Resumo

Ostariophysi é uma das maiores superordens de peixes, formada quase exclusivamente por espécies de água-doce, com cerca de 95 famílias, cerca de 1.500 gêneros e 11.000 espécies, contendo assim, aproximadamente, 30% das espécies de peixes conhecidas no mundo e quase 70% das espécies de água doce. Os Ostariophysi estão presentes em todo o mundo, exceto na Antártica, de onde são conhecidos apenas fósseis. Apesar da grande riqueza de espécies e, portanto, sua grande importância científica e econômica, existem ainda muitos problemas na identificação de espécies e no entendimento das relações entre os grupos internos da superordem (e consequentemente na sua classificação), assim como dúvidas nos seus processos de diversificação e biogeografia histórica, que precisam ser abordados com metodologias modernas e resolutivas. As relações filogenéticas de famílias e gêneros de Siluriformes, que corresponde a cerca de 40% de todos Ostariophysi, são ainda pouco conhecidas. Considerando que há muitas questões ainda a serem resolvidas em Siluriformes e dentro de Ostariophysi, os três principais objetivos do presente projeto são: (1) identificar, do ponto de vista molecular, todos os taxons a serem estudados em Siluriformes através da abordagem de DNA barcode; (2) testar a monofilia de Siluriformes e sua posição em Ostariophysi; e (3) estabelecer as relações filogenéticas entre as famílias que compõe a ordem Siluriformes e entre seus respectivos gêneros com base em análises filogenômicas usando sequências de elementos ultraconservados. Para abordar a questão da identificação molecular de todos os exemplares a serem analisados estamos propondo o sequenciamento completo de seus DNAs mitocondriais, o que vai permitir a criação de um grande banco de dados, que poderá ser utilizado futuramente em muitos projetos de DNA barcode (identificação molecular), projetos com objetivos ecológicos (DNA ambiental), de regulação e controle de espécies (DNA forense) e para elaboração de filogenias mitocondriais. Para abordar as questões sobre as relações entre os grupos (filogenias) e sobre seus processos de diversificação (macroevolução) e biogeografia histórica serão utilizados os marcadores chamados elementos ultraconservados (Ultraconserved Elements - UCEs). (AU)

Publicações científicas

(7)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SILVA, GABRIEL S. C.; ROCHA, MARCELO S.; MELO, BRUNO F.; REIA, LAIS; ROXO, FABIO F.; SABAJ, MARK H.; OLIVEIRA, CLAUDIO. Phylogenomics of the catfish family Pimelodidae with focus on the genus Pimelodus support the recognition of Sorubiminae and Pimelodinae (Teleostei, Siluriformes). ZOOLOGICA SCRIPTA, v. 53, n. 5, p. 14-pg., 2024-06-08. (21/12979-8, 20/13433-6, 16/11313-8, 23/09902-9, 22/13025-0, 14/26508-3)

SILVA, GABRIEL S. C.; OCHOA, LUZ E.; CASTRO, ITHALO S.. New species of Phenacorhamdia (Siluriformes: Heptapteridae) from the Xingu River basin. Neotropical Ichthyology, v. 20, n. 2, p. 12-pg., 2022-01-01. (21/12979-8)

CRISPIM-RODRIGUES, JEFFERSON L.; BERNT, MAXWELL J.; WALTZ, BRANDON T.; SILVA, GABRIEL S. C.; BENINE, RICARDO C.; OLIVEIRA, CLAUDIO; COVAIN, RAPHAEL; ROXO, FABIO F.. A new species of mailed catfish of genus Rhadinoloricaria (Siluriformes: Loricariidae: Loricariinae) from Rio Negro basin, Brazil. Journal of Fish Biology, v. 103, n. 1, p. 10-pg., 2023-05-11. (22/13025-0, 21/12979-8)

SILVA, G. A. B. R. I. E. L. S. C.; REIA, L. A. I. S.; MORIMOTO, C. E. S. A. R. K.; BENINE, R. I. C. A. R. D. O. C.; OLIVEIRA, C. L. A. U. D. I. O.. Integrative taxonomy of Imparfinis (Siluriformes, Heptapteridae) from the Upper Parana River basin, Brazil, with description of a new species. Zootaxa, v. 5249, n. 3, p. 21-pg., 2023-03-02. (16/09204-6, 21/12979-8, 14/26508-3, 18/20610-1)

SILVA, GUILHERME JOS DA COSTA; DA COSTA E SILVA, GABRIEL DE SOUZA; OLIVEIRA, CLAUDIO. A new species of spiny Rineloricaria (Siluriformes: Loricariidae) from the Rio Paraiba do Sul basin and costal rivers from Rio de Janeiro State. Zootaxa, v. 5175, n. 2, p. 8-pg., 2022-08-16. (16/09204-6, 09/50613-3, 21/12979-8, 18/20610-1, 20/13433-6, 14/26508-3)

CRISPIM-RODRIGUES, JEFFERSON LUAN; DA COSTA E SILVA, GABRIEL DE SOUZA; SHIBATTA, OSCAR AKIO; KURANAKA, MARIANA; OLIVEIRA, CLAUDIO. Description and phylogenetic position of a new species of Rhyacoglanis (Siluriformes: Pseudopimelodidae) from the Jamanxim River basin. Neotropical Ichthyology, v. 21, n. 3, p. 15-pg., 2023-01-01. (20/13433-6, 22/13025-0, 21/12979-8)

SILVA, GABRIEL DE SOUZA DA COSTA E; SABAJ, MARK HENRY; DE CARVALHO, KAYLANE RODRIGUES; OLIVEIRA, CLAUDIO. Integrative Taxonomy Reveals a New Species of Imparfinis (Siluriformes: Heptapteridae) from the Upper Xingu River Basin. ICHTHYOLOGY AND HERPETOLOGY, v. 113, n. 1, p. 11-pg., 2025-04-01. (21/12979-8, 20/13433-6, 22/13025-0)