O uso da técnica de enriquecimento híbrido ancorado (AHE) para análise da biodiversidade de Tanypodinae (Diptera: Chironomidae)

• Processo: 22/01094-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2022
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2022
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia - Taxonomia dos Grupos Recentes
• Pesquisador responsável: Fabio Laurindo da Silva
• Beneficiário: Ricardo Miranda Morelli
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/25567-0 - Origens ancestrais da diversidade Sul-Americana: integrando filogenética e biogeografia na compreensão dos processos de diversificação em Tanypodinae (Diptera: Chironomidae), AP.JP
• Assunto(s): Biodiversidade Biogeografia Filogenia Sistemática Sequenciamento de nova geração Tanypodinae
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biodiversidade | Biogeografia | Diversificação | Filogenia | Sistematica | Taxonomia | Filogenia

Resumo

O enriquecimento híbrido ancorado é uma forma de sequenciamento de última geração que usa sondas oligonucleotídicas para atingir regiões conservadas do genoma sobrepostas por regiões menos conservadas, a fim de adquirir dados úteis para a inferência filogenética de uma ampla gama de táxons. Originalmente desenvolvido para pesquisas médicas em doenças humanas, o enriquecimento híbrido é uma técnica flexível para a qual aplicações em pesquisa filogenômica estão apenas começando a ser percebidas. Ao contrário da reação em cadeia da polimerase tradicional (PCR), técnicas de enriquecimento híbrido podem ser usadas para isolar e amplificar muitos loci em uma única reação e, assim, melhorar significativamente a representação de espécies únicas em termos de cobertura gênica em análises filogenômicas. Além disso, uma vez desenvolvido o kit de sondas, o custo de um projeto aumenta principalmente pelo número de táxons adicionados, ao contrário do sequenciamento de Sanger, que aumenta pelo número de táxons e loci adicionados. Dessa forma, neste estudo todas as sequências de DNA serão inicialmente geradas a partir da técnica de enriquecimento híbrido ancorado, inédita no país. (AU)