Instalação e uso do software GLAPD (Genome based LAMP primer designer) em ambiente GPU e adaptação do aplicativo qLAMP app, com vistas ao desenvolvimento de reações de LAMP quantitativo em tempo real (qLAMP).

• Processo: 22/10231-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2022
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Regina Lucia Batista da Costa de Oliveira
• Beneficiário: David Aciole Barbosa
• CNAE: Atividades profissionais, científicas e técnicas não especificadas anteriormente
• Vinculado ao auxílio: 22/01026-2 - Desenvolvimento de um sistema de Point of Care Testing (PoCT) para a detecção e quantificação de microrganismos deteriorantes de cerveja em ambiente industrial, AP.PIPE
• Assunto(s): Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Glapd | Gpu | Lamp | qLAMP | Bioinformática

Resumo

O bolsista será responsável pela aplicação de conhecimentos de Bioinformática de maneira a executar a adaptação, instalação e manutenção da versão para GPU do GLAPD (Genome based LAMP primer designer) junto ao servidor virtual, bem como pelo desenho dos primers. O bioinformata também será responsável pelo desenvolvimento do API (Application Programming Interface) de temporização e por sua incorporação ao aplicativo qLAMP app.