Multilocus DNA barcode de espécies marinhas não representadas em banco de dados de sequências: subsídios para o DNA metabarcoding na costa de São Paulo

• Processo: 22/14631-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2023
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Oceanografia - Oceanografia Biológica
• Pesquisador responsável: Rodrigo Rodrigues Domingues
• Beneficiário: Eduarda Valério de Jesus
• Instituição Sede: Instituto Oceanográfico (IO). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/10201-0 - Biodiversidade marinha: uma exploração das ilhas costeiras de São Paulo usando DNA ambiental metabarcoding, AP.BTA.JP
• Bolsa(s) vinculada(s): 24/09214-8 - Barcoding e metabarcoding de espécies recifais das ilhas costeiras do litoral paulista, BE.EP.IC
• Assunto(s): Biodiversidade Ecologia molecular Identificação de espécies
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biodiversidade marinha | Ecologia molecular | genética marinha | Identificação de espécies | Ilhas Costeiras | Oceanografia | Oceanografia, Genética da conservação, Ecologia molecular

Resumo

O bioma marinho engloba uma rica biodiversidade, que, atualmente, sofre influências diretas e indiretas oriundas de atividades antrópicas, o que resulta em um desequilíbrio ecossistêmico, acarretando desastres ecológicos e perdas significantes. Nas últimas décadas vários métodos foram empregados para estimar a biodiversidade de uma região tais como cruzeiros científicos e acompanhamento dos desembarques de pesca, censo visual usando transectos lineares e filmagens subaquáticas remotas. Nos últimos anos, iniciaram-se os biomonitoramentos usando DNA, como por exemplo o consórcio DNA barcode, e depois, com o desenvolvimento da biotecnologia e aperfeiçoamento de novas técnicas moleculares, foram desenvolvidos métodos não invasivos para obtenção de amostras biológicas a partir de amostras ambientais, técnica conhecida como DNA ambiental (eDNA - sigla em Inglês). Essa técnica baseia-se no fato de que todos os animais marinhos liberam células na água por meio das fezes, muco, gametas, etc. Assim, esse material genético pode ser coletado através da filtração da água, permitindo a extração de DNA e a amplificação de um ou mais genes de várias espécies de diferentes grupos simultaneamente, por meio da técnica de metabarcoding. No entanto, para que esse monitoramento seja eficiente, é necessário bancos de dados com alta representatividade de sequências das espécies. Portanto, esse projeto objetiva complementar os bancos de dados (NCBI, BOLD, SILVA) com sequências (COI, 18s, 12s) das espécies de peixes, poríferos e antozoários que ocorrem em quatro ilhas costeiras de São Paulo, sendo elas: Ilha de Búzios, Refúgio da Vida Silvestre do Arquipélago de Alcatrazes, Parque Marinho da Laje de Santos e Ilha da Queimada Grande, o qual permitirá o biomonitoramento para a preservação da biota marinha e dinâmicas ecológicas desses ecossistemas via DNA ambiental.