O microbioma de um mega-rio: dos genes ao funcionamento do ecossistema(deepRIVER)

• Processo: 22/15842-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Ecologia - Ecologia de Ecossistemas
• Pesquisador responsável: Hugo Miguel Preto de Morais Sarmento
• Beneficiário: Maria Paula Huber
• Instituição Sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
• Auxílio(s) vinculado(s): 24/13550-3 - Distribuição Global, Diversidade e Nicho Ecológico de Picozoa, uma linhagem enigmática e amplamente distribuída de protistas marinhos, PUB.ART
• Assunto(s): Ecologia dos micro-organismos Ecologia microbiana
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Artificial Inteligence | bioinformatic | Fluvial systems | Functional diversity | metagenomes | microbial ecology | Ecologia Microbiana

Resumo

O rio Paraná é um dos mega-rios do mundo percorrendo 3.800 km pela América do Sul. É considerado um hotspot de biodiversidade que resulta da complexa combinação da heterogeneidade espaço-temporal, clima e hidrologia. Os microrganismos são sentinelas que podem ser usadas para diagnosticar o estado dos ecossistemas que habitam. O sequenciamento massivo é uma técnica de ponta que permite explorar a informação genética de toda a comunidade lótica: o microbioma aquático. O projecto deepRIVER tem como objetivo estudar o microbioma do rio Paraná e sua interação com os parametros ambientais. Perfis funcionais e taxonômicos serão analisados em diferentes escalas espaciais ao longo de todo o rio Paraná desde a nascente no Brasil até à foz na Argentina. Amostras de microbioma serão sequenciadas por tecnologia de ponta de sequenciamento metagenômico e modelos de deep learning para a análise de metagenomas serão desenvolvidos. Variáveis ambientais e mudanças no uso da terra devido à atividade humana serão analisadas para elucidar a interação dinâmica entre o microbioma e o meio ambiente. Os resultados obtidos nesse projeto de pesquisa serão fundamentais para elucidar o funcionamento de um sistema complexo como o rio Paraná e servirão de base para estudos do microbioma aquático e potenciais aplicações biotecnológicas.