Análise metagenômica dos efluentes de abatedouros de frango de corte como ação de vigilância na perspectiva de Saúde Única

• Processo: 23/00969-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2023
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Medicina Veterinária Preventiva
• Pesquisador responsável: João Pessoa Araújo Junior
• Beneficiário: Evelyn Cristine da Silva
• Instituição Sede: Instituto de Biotecnologia (IBTEC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Assunto(s): Avicultura Efluentes industriais Metagenômica Saúde Única Vigilância
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Avicultura | efluentes industriais | metagenômica | Saúde Única | vigilância | Saúde Única

Resumo

A avicultura brasileira é um dos setores mais importantes para a economia do país atualmente e a produção de carne de frango tem aumentado nos últimos anos. Atrelado ao nível elevado da produção, e inerente ao processo de abate das aves, há a formação de grandes volumes de efluentes industriais. Esses efluentes podem conter uma gama extensa de microrganismos patogênicos, caracterizando um risco sanitário, e genes resistentes a antibióticos (ARGs), que são considerados poluentes emergentes e de importância por ameaçar a produção animal, saúde pública e a segurança ecológica. Neste sentido o estudo dos efluentes de abatedouros são importantes como ação de vigilância em uma abordagem integrativa da Saúde Única. Assim o objetivo do estudo é analisar a metagenômica completa dos efluentes de abatedouros de frango de corte criados em dois sistemas de produção distintos, produção convencional e antibiotic-free, utilizando a genética molecular na pesquisa do microbioma, resistoma e viroma. O desenho experimental do estudo está baseado na coleta de 16 amostras de efluentes de abatedouros de frango de corte de dois sistemas de produção distintos, convencional e antibiotic-free, em quatro diferentes períodos do ano durante dois anos. O material genômico será extraído utilizando um protocolo in house com beads magnéticas e pelo kit MagMAX" Viral/Pathogen Nucleic Acid Isolation (Thermo Fisher Scientific®). Para o preparo das bibliotecas serão utilizados os kits Illumina DNA Prep e Illumina RNA Prep with Enrichment. O sequenciamento será realizado na plataforma NextSeq (Illumina, San Diego, CA) utilizando cartucho flow cell de 300 ciclos e os dados serão analisados nas plataformas de bioinformática mais atualizadas. Estudos como este são importantes como ação de vigilância em Saúde Única utilizando ferramentas ômicas para determinar os microrganismos presentes, sua composição e diversidade, seu potencial patogênico e quais genes de resistência a antibióticos (ARGs) são explorados nesses ambientes que são negligenciados na cadeia produtiva avícola e na vigilância em saúde.