Adaptação local a um gradiente altitudinal em populações do complexo Pitcairnia flammea Lindl. (Bromeliaceae) no sudeste do Brasil

• Processo: 23/05776-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2023
• Data de Término da vigência: 29 de setembro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Clarisse Palma da Silva
• Beneficiário: Paulo Aecyo Francisco da Silva
• Supervisor: Aureliano Bombarely Gomez
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas (IBMCP), Espanha
• Vinculado à bolsa: 22/04700-6 - Adaptação local a um gradiente altitudinal em populações do complexo Pitcairnia flammea Lindl. (Bromeliaceae) no sudeste do Brasil, BP.DR
• Assunto(s): Genômica populacional Sequenciamento completo do genoma Variação estrutural do genoma Evolução divergente
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Adaptação local | genômica de populações | Montagem de genoma à nível cromossômico | pangenoma | Resequenciamento do genoma | Variação Estrutural | Genômica populacional

Resumo

A adaptação local pode provocar a divergência genética populacional e culminar em eventos de especiação ecológica. Estudos anteriores sugerem que as populações do complexo de espécie Pitcairnia flammea (Bromeliaceae) estão divergindo graças ao processo de adaptação local à altitude e temperatura. O objetivo deste trabalho é entender como o processo de adaptação local a um gradiente altitudinal tem contribuído para a divergência genética das populações de Pitcairnia flammea no sudeste do Brasil. Para tanto, pretendemos montar e anotar o genoma em escala cromossômica da espécie, utilizando sequências de PacBio HiFi e Omni-C. Posteriormente, alguns indivíduos distribuídos sobre um gradiente altitudinal serão ressequenciados em uma cobertura média para detectar toda a variação do pool gênico da espécie, ou seja, o pangenoma. Com este pangenoma montado, será realizada uma abordagem genômica populacional onde pretende-se: (I) caracterizar as variações estruturais presentes no pangenoma de P. flammea e observar como elas estão estruturadas entre suas populações; (II) discernir o papel de cada força evolutiva no processo de divergência genética populacional e consequente especiação das populações de P. flammea no cline altitudinal na Floresta Atlântica; e (III) identificar quais as bases genéticas responsáveis pelas adaptações locais dessas populações e como o ambiente tem influenciado este processo. Dessa forma, este trabalho visa entender como o ambiente pode promover a divergência genética de populações localmente adaptadas, contribuindo para a elucidação dos primeiros passos do processo de especiação em uma das áreas mais biodiversas do mundo e fazer predições sobre a resiliência das espécies frente às mudanças climáticas. (AU)