Análise de sequências de anticorpos por RNA-Seq e por espectrometria de massas.

• Processo: 23/10925-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2023
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2024
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Saúde Coletiva - Saúde Pública
• Pesquisador responsável: Alexandre Keiji Tashima
• Beneficiário: Claudia de Paula Santos
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/05975-6 - Anticorpos contra o SARS-CoV-2 do plasma de vacinados: dinâmica da resposta humoral, sequenciamento, expressão e efetividade dos recombinantes para terapia e diagnóstico, AP.R
• Assunto(s): Anticorpos COVID-19 Proteômica Análise de sequência de RNA Vacinação Virologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Anticorpos | Covid-19 | proteômica | RNA-seq | Vacinação | Virologia

Resumo

A bolsista TT-3 aprenderá e contribuirá com o desenvolvimento de protocolos de preparação de cDNA e amplicons de sequências de cadeias leves e pesadas de anticorpos contra o SARS-CoV-2. Além disso, a bolsista realizará protocolos de purificação de anticorpos do plasma e aprenderá os protocolos de análise proteômica por espectrometria de massas. Participará da elaboração de ferramentas de bioinformática direcionadas à análise de dados de sequenciamento de RNA, obtidas principalmente pela plataforma MinION Mk1C (Oxford Nanopore Technologies), e comparará as sequências consolidadas com sequências depositadas em bancos de dados públicos.