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Análise do repetoma da orquídea Epidendrum denticulatum Barb. Rodr.: uma abordagem comparativa entre as populações dos biomas Mata Atlântica e Cerrado

Processo: 23/05740-4
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Mestrado
Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2023
Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2025
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Botânica
Pesquisador responsável:Ana Paula de Moraes
Beneficiário:Ana Carolina Humberto
Instituição Sede: Centro de Ciências Naturais e Humanas (CCNH). Universidade Federal do ABC (UFABC). Ministério da Educação (Brasil). Santo André , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:21/10639-5 - Centro de Pesquisa em Biodiversidade e Mudanças do Clima, AP.CEPID
Assunto(s):Biologia computacional   Sequências repetitivas de ácido nucleico   DNA satélite
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:bioinformática | DNA repetitivo | DNA satélite | Elemento transponível | Tamanho de genoma | Evolução vegetal, Citogenômica vegetal

Resumo

Variações de tamanho de genoma são consideradas uma das principais barreiras reprodutivas pós-zigóticas em plantas e, quando tais variações são observadas entre populações de uma mesma espécie, podem indicar um processo de especiação incipiente. Epidendrum denticulatum (2n=52), distribuída nos biomas de Mata Atlântica e Cerrado, apresenta variação de tamanho de genoma entre os dois biomas, com populações do Cerrado apresentando maior conteúdo genômico (2C=5,82pg) em relação às populações de Mata Atlântica (2C=5,27pg). Análises prévias de envelope climático indicaram que E. denticulatum colonizou inicialmente as matas do sul do Brasil (Mata Atlântica) e a migração desta espécie para o Cerrado no sudeste do Brasil ocorreu logo após o período Quaternário. O stress causado por mudanças ambientais pode ter servido de gatilho para alterações genômicas, causando o aumento do tamanho de genoma nas populações de Cerrado. Entretanto, para validar essa hipótese, faz-se necessário realizar uma análise comparativa da composição do repetoma das populações de E. denticulatum dos dois biomas. Desta forma, o presente projeto visa responder três perguntas principais: (1) Qual(is) sequência(s) é/são responsável(is) pela variação de tamanho de genoma entre os indivíduos de populações de E. denticulatum da Mata Atlântica e do Cerrado?; (2) Como tais sequências se distribuem nos cromossomos dos indivíduos da Mata Atlântica e do Cerrado? (3) O tempo de divergência das sequências presentes nas populações de Mata Atlântica e Cerrado é compatível com os resultados das análises de envelope climático, que sugerem a migração de E. denticulatum para o Cerrado durante o período Quaternário?

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