Identificação de módulos de co-expressão associados ao enriquecimento de células-tronco hematopoiéticas de potencial de enxertia de longa duração (LT-HSC) nos níveis transcricional e proteico

• Processo: 23/17638-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Karina Griesi Oliveira
• Beneficiário: Victoria de Paiva Oliveira
• Instituição Sede: Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein (IIEPAE). Sociedade Beneficente Israelita Brasileira Albert Einstein (SBIBAE). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 22/03118-1 - Identificação e avaliação de assinatura de expressão gênica de células-tronco hematopoiéticas por abordagens de biologia de sistemas e aprendizado de máquina, AP.PNGP.PI
• Assunto(s): Biologia de sistemas Células-tronco hematopoéticas Expressão gênica Proteômica Transcriptômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biologia de sistemas | Celulas-Tronco Hematopoieticas | expressão gênica | proteômica | Transcriptômica | Wgcna | Expressão gênica

Resumo

As células-tronco hematopoiéticas com potencial de enxertia de longo prazo (longterm hematopoietic stem cells - LT-HSC) são as únicas células capazes de reconstituir a medula óssea, gerando todas as linhagens celulares que compõem o sangue, tendo, portanto, grande relevância em um contexto de transplante medular. As LT-HSC são células raras e, dado que o sucesso de um transplante depende da quantidade deste tipo transplantado, sua expansão in vitro sempre foi um objetivo da medicina. No entanto, ainda não se conseguiu reproduzir condições que permitam a expansão a níveis desejáveis destas células sem a perda de sua potencialidade. Nas otimizações dos protocolos de expansão é preciso, ao final, avaliar tanto o número de LT-HSC quanto sua funcionalidade, outro importante desafio. Embora alguns marcadores de superfície de LT-HSC cultivadas tenham sido reportados recentemente, estes podem perder sua validade a depender da condição de cultivo por serem moléculas susceptíveis a variações do ambiente, tornando necessária a avaliação da manutenção da funcionalidade destas células por ensaios de xenotransplante a cada alteração no protocolo de cultivo. Desta forma, este projeto tem como objetivo a geração de dados de transcriptoma e proteoma para LT-HSC partir de células frescas e cultivadas in house e, por meio da correlação com a análise de dados de transcriptoma de LT-HSC disponíveis publicamente, selecionar um conjunto de genes centrais de módulos de expressão que se mostrarem associados a LT-HSC.