Programa de Treinamento, Manuseio e Gestão dos equipamentos designados para atividades de Multiômica Espacial para pesquisas nas áreas de Oncologia, Neurociência e Imunologia

• Processo: 23/18082-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2024
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Farmacologia - Farmacologia Bioquímica e Molecular
• Pesquisador responsável: Soraya Soubhi Smaili
• Beneficiário: Ana Luisa Pedroso Ayub
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 22/11571-8 - EMU científico: aquisição de Plataforma NanoString GeoMx Digital Profiler para a implantação do Laboratório Multidisciplinar de Multiômica Espacial (LMME), AP.INFRA7.CI
• Assunto(s): Doenças neurodegenerativas Oncologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Doenças Neurodegenerativas | Laboratório Multiômica | Oncologia | redes de colaboração | 3d | Oncologia

Resumo

Implementação de três equipamentos complementares para análises multiômicas espaciais: 1) GeoMx, plataforma totalmente integrada capaz de determinar o perfil de RNAs e/ou de proteínas dentro de um contexto espacial (in situ) em diferentes regiões de um único corte de tecido. As sondas utilizadas na detecção são complexadas a "códigos de barras" individuais e fotocliváveis (photocleaved oligo) que, quando expostos à luz UV, são clivados e coletados para leitura, seguido da quantificação digital dos alvos analisados. Na plataforma, é possível selecionar com precisão até 12 regiões de interesse por amostra. 2) nCounter Analysis System é uma plataforma utilizada para a quantificação dos oligos clivados no GeoMX, que também pode ser utilizado separadamente para a quantificação não espacial de mRNAs, miRNAs, lncRNAs e proteínas. 3) A implementação do equipamento de PCR digital permitirá analisar e quantificar amostras DNA e RNA com alta sensibilidade e, desta forma, poderá ser utilizado na análise de biópsias líquidas, carga viral e outras moléculas com alta sensibilidade.