Infraestrutura em bioinformática para a genômica comparativa de plantas e microbiomas

• Processo: 24/04607-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2024
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Mauricio Bacci Junior
• Beneficiário: Paula Maria Moreira Martins
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/10639-5 - Centro de Pesquisa em Biodiversidade e Mudanças do Clima, AP.CEPID
• Assunto(s): Diversidade microbiana Ecologia microbiana Microbiologia do solo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Associação plant-microrganismo | Biblioteca ITS | Biblioteca 16S | diversidade microbiana | Ecologia microbiana | Microbiologia do solo | Microbiomas

Resumo

Recentemente, uma importante iniciativa colaborativa internacional estabeleceu o projeto Earth BioGenome (https://www.earthbiogenome.org). O projeto Earth BioGenome tem como objetivo central aumentar a compreensão da biodiversidade terrestre, por meio do sequenciamento, catalogação e caracterização dos genomas de toda a biodiversidade eucariótica da Terra durante um período de 10 anos.Alinhado a esta iniciativa, 0 presente projeto TT5 pretende apoiar trabalhos para explorar a diversidade e estrutura genômica de plantas e microrganismos, com ênfase no fluxo gênico entre espécies e estudo de genes relacionados à adaptabilidade. Com os genomas sequenciados, incluindo organelas (DNA cloroplastidal e mitocondrial) e microbiomas associados, de diversas espécies vegetais e microbiomas associados, será possível realizar análise comparativa entre essas espécies, desenvolvimento de marcadores moleculares, identificação de genes funcionais e inferências de propriedades fisiológicas, bem como uma possível associação com o impacto que o microbioma associado exerce na estrutura genômica. Nas análises genómicas comparativas serão incluídas informações sobre o transcriptoma de cada espécie vegetal, pelo que também será possível identificar genes funcionais, eventos de splicing e identificação e análise do fluxo génico entre estas espécies, em particular genes relacionados com a adaptabilidade a diferentes ambientes. Para estes efeitos, o candidato utilizará diversas técnicas de genômica comparativa, nomeadamente técnicas baseadas na análise de enriquecimento de Ontologia genética.