Papel dos RNAs longos não-codificantes (lncRNAs) na comunicação célula-célula e na matriz extracelular pós-infarto do miocárdio

• Processo: 24/04572-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 30 de agosto de 2024
• Data de Término da vigência: 29 de maio de 2025
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: José Eduardo Krieger
• Beneficiário: Caio Mateus da Silva
• Supervisor: Evangelia Petsalaki
• Instituição Sede: Instituto do Coração Professor Euryclides de Jesus Zerbini (INCOR). Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP (HCFMUSP). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: European Bioinformatics Institute, Inglaterra
• Vinculado à bolsa: 21/08797-1 - Identificação e caracterização de RNAs longos não-codificantes (lncRNAs) que modulam a matriz extracelular cardíaca, BP.DR
• Assunto(s): Infarto do miocárdio RNA longo não codificante Redes de interação Cardiologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: comunicação célula a célula | infarto do miocárdio | LncRNA | Matrix Extracelular | redes de interação | single-cell RNA-Seq | Cardiologia

Resumo

Introdução: O infarto do miocárdio (IAM) é uma das principais causas de mortalidade em todo o mundo. O IAM inicia mecanismos de reparo cardíaco que levam à deposição de matriz extracelular (MEC) e subsequente fibrose cardíaca. Após o infarto, o coração sofre alterações celulares e moleculares significativas, impactando as interações celulares. Dentre as estratégias terapêuticas avançadas, RNAs longos nã-codificantes (lncRNAs) emergem como reguladores da expressão gênica, mostrando-se promissores no tratamento do IAM devido à sua influência na comunicação celular e na modulação da MEC. Objetivo: Este estudo visa elucidar o papel dos lncRNAs na modulação da comunicação célula a célula e seu subsequente impacto na MEC pós-infarto. Métodos: Nossa abordagem envolve uma reanálise de dados de sequenciamento de RNA de células únicas (scRNA-seq) de Kuppe et al., 2022, (31 amostras coletadas de várias regiões cardíacas de 23 pacientes, variando de 3 a 150 dias pós-infarto) com foco na extração de redes de sinalização específicas do tipo de célula. Empregaremos métodos de propagação de rede e analisaremos a comunicação célula-célula através de interações ligante-receptor para identificar pares lncRNA-RNA co-regulados pós-IAM. Além disso, aplicaremos métodos de inferência para deduzir as funções regulatórias dos lncRNAs dentro dessas redes. O objetivo final é descobrir alterações nas redes de interação célula-célula, particularmente em fibroblastos, e identificar lncRNAs associados a processos de remodelação da MEC pós-IAM.