Implementação de Metodologia Numérica para Integração de Dados obtidos por Simulações de Dinâmica Molecular e SAXS/SANS em Membranas Biológicas

• Processo: 24/09991-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Física - Física da Matéria Condensada
• Pesquisador responsável: Thereza Amélia Soares da Silva
• Beneficiário: Anderson Aparecido do Espirito Santo
• Instituição Sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 22/07231-7 - Plasticidade e modulação funcional de proteínas intrinsecamente desordenadas, AP.TEM
• Assunto(s): Desenvolvimento de software Espalhamento de raios X a baixos ângulos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Algoritmo numérico | Desenvolvimento de Software | NMR e NOEs | Sans | Saxs | Simulação de Matéria Macia | Simulação de Membranas Biologicas | Simulação de Membranas Biológicas

Resumo

Um dos principais desafios na biologia é oferecer uma descrição detalhada, em nível atômico, das funções de biomoléculas. Grandes avanços foram obtidos através da integração sinérgica de experimentos e simulações. Enquanto os experimentos são usados para refinar as simulações, as simulações são usadas para interpretar os experimentos, possibilitando assim uma compreensão detalhada de complexos biomoleculares. No cerne dessa integração experimento-simulação está o desenvolvimento e implementação de algoritmos em ferramentas computacionais. Neste projeto propomos contribuir para a área através do desenvolvimento e implementação de um algoritmo para integrar dados de SAXS/SANS (primeiro ano) e NMR (segundo ano) em simulações de dinâmica molecular para a caracterização estrutural dos sistemas abordados no projeto Temático ao qual o presente projeto está assoociado.