Montagem e análise comparativa de espécies de Vellozia: um estudo para compreensão adaptativa em resposta a seca

• Processo: 24/11068-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2024
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Isabel Rodrigues Gerhardt
• Beneficiário: Francine Alves Nogueira de Almeida
• Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Empresa: Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG)
• Vinculado ao auxílio: 16/23218-0 - Centro de Pesquisa em Genômica Aplicada às Mudanças Climáticas, AP.PCPE
• Assunto(s): Estresse hídrico Genômica Biotecnologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: assembly | Estresse Hídrico | Genomics | Vellozia | Biotecnologia

Resumo

O gênero Vellozia, pertencente à família Velloziaceae, inclui espécies que habitam regiões de camposrupestres. Essas espécies são compostas por membros tolerantes à dessecação e à seca, o quepermite estudos comparativos de espécies proximamente relacionadas que apresentam estratégiascontrastantes de resposta a estresses. Esta proposta tem como objetivo explorar essascaracterísticas, ao comparar os genomas de espécies de Vellozia, a saber: Vellozia tubiflora e V. nivea(espécies tolerantes à dessecação) e Vellozia peripherica e V. intermedia (espécies não tolerantes àdessecação e sim resistentes à seca). A comparação dos genomas dessas espécies permitirá aidentificação de elementos genômicos que podem contribuir para adaptações ecológicas,fornecendo um banco de dados para futuras pesquisas em melhoramento genético e fisiologiavegetal. Na primeira fase do projeto será realizada a montagem e anotação dos genomas dasespécies Vellozia tubiflora e Vellozia peripherica utilizando tecnologias de sequenciamento de novageração, combinadas com abordagens bioinformáticas, buscaremos gerar genomas completos eanotados. Esses dados servirão como uma base robusta para análises subsequentes, permitindo aidentificação de genes relacionados à resistência à seca e dessecação. Na segunda fase, serãorealizadas análises de genômica comparativa entre as quatro espécies de Vellozia. Essas análisesincluirão a identificação de regiões genômicas conservadas e divergentes, genes ortólogos eparálogos, expansão e contração de famílias gênicas bem como elementos regulatórios que possamestar associados às suas diferentes estratégias adaptativas ao déficit hídrico. Comparar os genomasdas espécies permitirá uma compreensão mais profunda dos mecanismos genéticos que conferem acapacidade de sobreviver e prosperar em condições de seca extrema. Os resultados deste projetoproporcionarão novos recursos sobre a evolução e a biologia adaptativa das espécies de Vellozia,além de contribuir significativamente para a compreensão das interações planta-ambiente emecossistemas de alta variabilidade climática. Esse conhecimento é crucial não apenas para aconservação das espécies de Vellozia e seus habitats, mas também para o desenvolvimento deestratégias de melhoramento genético e biotecnologia vegetal, visando a produção de culturas maisresistentes à seca e ao estresse ambiental.