Validação de primers metabarcode para a detecção das espécies bioconstrutoras do litoral de São Paulo, Brasil

• Processo: 24/10997-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2024
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Oceanografia - Oceanografia Biológica
• Pesquisador responsável: Rodrigo Rodrigues Domingues
• Beneficiário: Isabela Buxbaum Marinho Guerra
• Supervisor: Matthieu Leray
• Instituição Sede: Instituto Oceanográfico (IO). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Smithsonian Institution, Panamá, Panamá
• Vinculado à bolsa: 23/09317-9 - Desenvolvimento e validação de primers metabarcode para o levantamento de Poríferos e Cnidários das ilhas costeiras do Estado de São Paulo por meio da técnica de metabarcode, BP.IC
• Assunto(s): Biodiversidade Cnidários DNA ambiental Ecologia molecular Porifera
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biodiversidade marinha | Cnidaria | DNA ambiental | Ecologia molecular | Porifera | Oceanografia, genética, ecologia marinha

Resumo

A compreensão da biodiversidade associada a determinados ecossistemas é fundamental para o entendimento de padrões biogeográficos e, principalmente, para o desenvolvimento de estratégias de análise, prevenção e contorno de possíveis desequilíbrios ecológicos. Este aspecto vem apresentando crescente relevância no ambiente marinho nos últimos anos, visto que o aumento das atividades e das influências antrópicas neste meio tem acarretado alterações notáveis no número de espécies e de indivíduos habitantes de determinadas regiões, em decorrência, por exemplo, da pesca, do descarte irregular de resíduos industriais e da introdução de espécies invasoras no local, o que, por sua vez, desestabiliza as relações ecológicas harmônicas mantidas entre os diferentes níveis tróficos presentes no ecossistema. Neste sentido, métodos moleculares de análise da biota apresentam-se como alternativas viáveis e eficientes para os estudos da biodiversidade dos mais diversos ecossistemas marinhos. A técnica de metabarcode é capaz de realizar a identificação das diferentes espécies de organismos presentes em um determinado local a partir da análise de diferentes regiões genômicas (e.g., 18S, 12S, COI) do material genético extraído de uma amostra ambiental. No entanto, um dos aspectos mais cruciais na eficiência do metabarcode é a utilização de primers específicos para um determinado grupo e que sejam capazes de detectar o maior número possível de espécies, de maneira a reduzir a conclusão de falsos positivos e/ou negativos que venham a afetar diretamente o resultado da análise. Deste modo, o presente projeto pretende desenvolver e validar primers para as espécies de poríferos e cnidários, com o intuito de favorecer o entendimento e a conservação da biodiversidade desses grupos nesta região.