Decifrando o pigmento azul indigoidina de bactérias modificadas usando uma abordagem multi-ômica para melhorar a bioprodução

• Processo: 24/07523-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Danielle Biscaro Pedrolli
• Beneficiário: Getachew Tafere Abrha
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCFAR). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Araraquara. Araraquara , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 22/07368-2 - Explorando a diversidade metabólica para a produção sustentável de bioproduto, AP.BIOEN.R
• Assunto(s): Bactérias Biologia sintética Genômica Metabolômica Transcriptômica Biologia sistêmica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bacteria | Biologia Sintetica | Genômica | Indigoidine | Metabolomica | Transcriptômica | Biologia sistêmica

Resumo

In the last year, the SynBio research group has engineered two bacterial strains for the production of indigoidine, the heterotrophic Bacillus subtilis and the chemotrophic Cupriavidus necator. Next, we edited genome-scale metabolic models available to include the indigoidine biosynthetic pathway and precursors. Based on targets identified by in silico analysis of the metabolic fluxes, we edited the B. subtilis producing strain aiming at improving the indigoidine production. From the four targets identified, we built six edited strains carrying one or two editions each. Three of the engineered strains produce more indigoidine than the parental strain. The other three strains are worse producers than the parental strain. The selected targets have different cellular functions and may influence global metabolic responses. Based on that, we propose a multi-omics approach to better understand the metabolism of the edited strains. The results should foment future new editions and improvement of the metabolic models.