Análise da plasticidade genômica de E. coli patogênica híbrida do sorotipo O3:H2 e influência na sua patogenicidade

• Processo: 24/18627-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2025
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: Rodrigo Tavanelli Hernandes
• Beneficiário: Daiany Ribeiro Paz de Lira
• Supervisor: Ulrich Dobrindt
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Munster, Alemanha
• Vinculado à bolsa: 22/08132-2 - Explorando a metamorfose patogênica de Escherichia coli do sorotipo O3:H2 associada às infecções humanas, BP.DR
• Assunto(s): Microbiologia médica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: EAEC hybrid | ExPEC | genomic plasticity | Pathogenicity | Pathogenicity island | Microbiologia Médica

Resumo

Embora descrita como Escherichia coli diarreagênica, vários estudos na literatura estão acumulando evidências de que isolados de E. coli enteroagregativos (EAEC) podem estar associados a infecções extraintestinais, como bacteremia e infecções do trato urinário. Aqui, analisamos a presença dos cinco genes classificatórios de E. coli patogênica extraintestinal (ExPEC) (papA e/ou papC, afa/dra, sfa/foc, kpsMTII e iutA), que indicam o potencial intrínseco de isolados de E. coli para causar infecções extraintestinais em indivíduos saudáveis, em uma coleção de 26 isolados de EAEC do sorotipo O3:H2 (22 de fezes e 4 de urina). Esta investigação mostrou que esses genes foram encontrados em cinco combinações distintas. Selecionamos um isolado representativo (UPEC34), com o maior número de genes classificatórios ExPEC, e realizamos sequenciamento de leitura curta e longa. Esta análise mostrou que os genes pap, iutA, kpsMTII e afaBC estão colocalizados em uma única ilha de patogenicidade (PAI) com similaridade ao PAICFT073-pheV (ICFT073) localizado no cromossomo. Este PAI tem 159,2 kb de comprimento, compreende 156 sequências codificadoras e abriga vários genes codificadores de fatores de virulência geralmente presentes em isolados ExPEC. O principal objetivo do presente estudo é investigar a plasticidade genômica da ilha semelhante ao PAI I-CFT073-pheV (ICFT073) encontrada nos isolados híbridos ExPEC/EAEC do sorotipo O3:H2, e revelar como o ganho ou perda de alguns dos genes codificadores de fatores de virulência deste PAI afeta a patogenicidade desses híbridos em causar infecção extraintestinal.