Genômica populacional do fitopatógeno obrigatório Candidatus Liberibacter asiaticus

• Processo: 24/18844-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: Filipe Pereira Matteoli
• Beneficiário: Anna Julia Chen
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências (FC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Bauru. Bauru , SP, Brasil
• Assunto(s): Citricultura Evolução molecular Fitossanidade
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Citricultura | evolução molecular | fitopatogenicidade | Fitopatógeno bacteriano | Fitossanidade | Interação bactéria - planta

Resumo

As bactérias ambientais desenvolvem múltiplas relações ecológicas com as plantas, desde a fitopatogenia até a promoção do crescimento vegetal. Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) é uma bactéria ambiental, não cultivável por ser um patógeno intracelular obrigatório. Nos citros, CLas é o agente etiológico da doença Huanglongbing (HLB), um flagelo que causa impactos significativos aos produtores desta importante commodity agrícola. A contaminação das plantas ocorre via um hospedeiro invertebrado, o psilídeo Diaphorina citri. Apesar de amplamente conhecida quanto aos seus efeitos devastadores nos citros, o manejo do HLB é feito majoritariamente por práticas que visam conter o contágio ou a dispersão do vetor, uma vez que pouco se sabe sobre os mecanismos moleculares que possibilitem o controle da infecção após a colonização da planta. Nos últimos anos, a popularização dos métodos de sequenciamento de reads longos tornou possível a obtenção de genomas montados a partir de metagenomas (MAGs) de qualidade superior. Desde então, análises bioinformática de MAGs de várias espécies de Candidatus Liberibacter em associação com genomas da espécie cultivável Liberibacter crescens estão desvendando aspectos sobre a biologia e evolução deste elusivo grupo de procariotos. Apesar dos avanços, nenhum estudo se aprofundou nas características genômicas populacionais do principal fitopatógeno do grupo, a bactéria CLas. Assim, propomos a realização do primeiro estudo populacional de Candidatus Liberibacter asiaticus, por meio da análise de todos os 36 MAGs presentes no banco de dados RefSeq desta espécie. Nós almejamos caracterizar o pan-genoma e aferir a distribuição e a conservação de genes associados ao modo de vida fitopatogênico, tais como: Sec-translocon, regiões oriundas de profagos, regiões plasmidiais e genes tad. Os resultados permitirão expandir a compreensão acerca dos mecanismos moleculares da interação entre CLas e plantas.