Coleta, checagem e quantificação de amostras para análise genômica em Chamaecrista

• Processo: 25/05918-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Botânica
• Pesquisador responsável: Anselmo Nogueira
• Beneficiário: Amanda Vieira da Silva
• Instituição Sede: Centro de Ciências Naturais e Humanas (CCNH). Universidade Federal do ABC (UFABC). Ministério da Educação (Brasil). Santo André , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/19544-7 - Efeitos sinérgicos de múltiplos mutualistas nas plantas: como bactérias, formigas e abelhas contribuem para a evolução de um grupo de leguminosas, AP.BTA.JP
• Assunto(s): Macroevolução Mutualismo Filogenia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Macroevolução | mutualismos | Sistemática filogenética | Botânica Funcional

Resumo

Um gargalo identificado no projeto Jovem Pesquisador está relacionado à árvore filogenética que temos disponível para a linhagem de Chamaecrista. A árvore filogenética é imprescindível para a execução do objetivo 2 do projeto JP no qual serão testadas as hipóteses macroevolutivas para os três mutualismos nas plantas. Atualmente, com base nos acessos doGenBank, temos apenas 5 tipos de marcadores moleculares (3 plastidiais - matK/trnK, trnL-F, trnD-T, e 2 nucleares - ETS e ITS) sequenciados de forma mais abrangente em espécies de Chamaecrista. Estes marcadores embasaram filogenias já publicadas. Todavia, o número de espécies incluídas e a resolução das árvores filogenéticas disponíveis ainda é limitada (36% das espécies com múltiplas sequências), e menos da metade da diversidade de espécies de Chamaecrista foi amostrada, e destas grandes partes possui uma diversificação recente com consequente baixa resolução nas relações deparentesco entre as espécies. Soma-se a isso o fato de que a maior parte dos esforços de sequenciamento foram feitos de maneira difusa, levando a uma série de trabalhos com métodos dispares, e que geraram hipóteses filogenéticas conflitantes. Isso tudo cria uma instabilidade aos estudos evolutivos que se baseiam em hipóteses filogenéticas baseadasem poucos marcadores incompletos para poucas espécies. A falta de uma filogenia ampla e robusta representa uma enorme lacuna de conhecimento sobre a história do grupo, e um dos principais gargalos atuais do projeto a qual essa bolsa está vinculada. Sendo assim, pretende-se que o beneficiário da bolsa TT4 possa auxiliar na coleta, organização/acondicionamento e tratamento das amostras de espécies de Chamaecrista que serão utilizadas em uma nova amostragem genômica para a criação de uma filogenia robusta e estável para o grupo. Para isso, o bolsista auxiliará nasatividades de identificação e obtenção de amostras em coleções botânicas e bancos de DNA. Todas as etapas descritas visam permitir a plena execução do objetivo 2 do projeto Jovem Pesquisador em que a bolsa está vinculada, no qual a amostragem e organização de amostras de diferentes espécies de Chamaecrista são fundamentais. Espera-se umaperfeiçoamento da capacidade do bolsista nas áreas de desenho amostral, assim como o treinamento para identificação de espécies de plantas, trabalhos de preservação e cuidados em herbários, acondicionamento e preservação de amostrasbiológicas, e extração e quantificação de DNA em plantas.