Investigação etiológica em pacientes com alterações fenotípicas e rearranjos cromossômicos equilibrados

• Processo: 24/18075-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2030
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Maria Isabel de Souza Aranha Melaragno
• Beneficiário: Michael Wendel da Silva
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/21644-0 - Impacto de variantes genéticas na estabilidade do genoma e seus efeitos no fenótipo, AP.TEM
• Assunto(s): Variação fenotípica Citogenética Cromossomos Citogenômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Alterações fenotípicas | Citogenética | cromossomos | Mapeamento Óptico do Genoma | Rearranjos cromossômicos equilibrados | Citogenômica

Resumo

Dentre os portadores de rearranjos cromossômicos equilibrados, que não apresentam perda nem ganho de material genético, aproximadamente 6% apresentam anormalidades fenotípicas. Essas podem ser atribuídas a diferentes mecanismos patogênicos, como variações no número de cópias (CNVs) não detectadas pelo cariótipo, rupturas de genes, fusões gênicas, efeitos de posição, além de alterações nos domínios topologicamente associados (TADs) e nas interações genômicas. Alternativamente, o rearranjo cromossômico pode ser uma associação casual, sem impacto no fenótipo. Este projeto visa investigar e caracterizar os mecanismos patogênicos em pacientes com alterações fenotípicas e rearranjos cromossômicos equilibrados. Os pacientes passarão por uma avaliação clínica detalhada e serão submetidos a diferentes abordagens diagnósticas. Inicialmente, será realizado o microarray cromossômico para o estudo de CNVs. O mapeamento óptico do genoma (OGM) e o sequenciamento de Sanger dos pontos de quebra permitirão investigar rupturas e fusões gênicas. A análise in silico dos TADs e das interações gênicas e proteicas alteradas será realizada com os dados de OGM e Sequenciamento de Sanger. Nos casos em que a etiologia diagnóstica não for identificada, será realizado o sequenciamento completo do genoma. Além disso, todos os pacientes terão a correlação genótipo-fenótipo estudada. Espera-se que os resultados desta pesquisa aprimorem o acompanhamento clínico e o prognóstico dos pacientes, além de ampliar o conhecimento sobre os rearranjos cromossômicos equilibrados.