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Estudo do transcriptoma do Tanaidáceo Monokalliapseudes schubarti exposto a sedimentos contaminados

Processo: 25/08901-4
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Mestrado
Data de Início da vigência: 01 de julho de 2025
Data de Término da vigência: 30 de junho de 2027
Área de conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Oceanografia - Oceanografia Biológica
Pesquisador responsável:Lucas Buruaem Moreira
Beneficiário:Agatha Kyara Rodrigues Dorte
Instituição Sede: Instituto do Mar (IMar). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus Baixada Santista. Santos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:20/00068-8 - Análise global do transcriptoma de organismos bentônicos usados como modelos para caracterização de efeitos tóxicos de sedimentos marinhos contaminados, AP.BTA.JP
Assunto(s):Biomarcadores   Crustacea   Ecotoxicologia marinha   Expressão gênica   Poluição do mar   Análise de sequência de RNA   Ecotoxicologia
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:biomarcadores | Crustacea | Ecotoxicologia Marinha | expressão gênica | poluição marinha | RNAseq | Ecotoxicologia

Resumo

No Brasil existem poucos modelos bentônicos usados em testes de toxicidade de sedimentos, e para aqueles já amplamente utilizados, o conhecimento é incipiente sobre os mecanismos de toxicidade ativados a partir da exposição no teste, e que geram os efeitos nos diferentes níveis de organização biológica. Como importantes modelos, destacam se o tanaidáceo Monokalliapseudes schubarti, que possui tolerância a diferentes compostos. Para essas espécies, os protocolos padronizados focam apenas em parâmetros de efeitos letais, sem detalhar de forma elucidativa, quais os mecanismos responsáveis pela toxicidade. Com isso, o objetivo contemplado neste plano de trabalho é elucidar os mecanismos moleculares associados aos eventos iniciadores de efeitos tóxicos através da análise global do transcriptoma M. schubarti, expostos a sedimentos contaminados. A partir da exposição, o RNA mensageiro total e individual será isolado e sequenciado coma plataforma NextSeq 2x100. Os reads gerados pelo sequenciamento, somado a montagem dos contigs possibilitaram a anotação dos genes, com auxílio de banco de dados como GeneBank e Gene Ontology. Em seguida será feita a anotação funcional com o objetivo de identificar as principais respostas moleculares associadas a exposição aos contaminantes e que podem auxiliar no desenvolvimento de biomarcadores para estas espécies. (AU)

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