Decodificação de RNAs longos não codificadores associados a células-tronco em gliomas por meio de abordagens de célula única e baseadas em redes

• Processo: 25/08370-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 12 de janeiro de 2026
• Data de Término da vigência: 11 de setembro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética
• Pesquisador responsável: Eduardo Moraes Rego Reis
• Beneficiário: Daniela Bizinelli
• Supervisor: Michele Ceccarelli
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Miami, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 24/02910-9 - Identificação de RNAs longos não codificantes associados ao potencial tronco tumoral em câncer de pâncreas, glioblastoma e melanoma, BP.DR
• Assunto(s): Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: gene co-expression networks | Glioma stem cells | Prognostic Biomarkers | single-cell RNA sequencing | stemness-associated lncRNAs | Bioinformática

Resumo

Os gliomas estão entre as malignidades mais desafiadoras do sistema nervoso central, com os subtipos IDH-mutante (IDHmut) e IDH-wildtype (IDHwt) apresentando prognósticos ruins e opções limitadas de tratamento. Apesar dos avanços na classificação molecular, as células-tronco de glioma (GSCs) continuam sendo impulsionadoras chave da resistência terapêutica. Este estudo investiga os longos RNAs não codificantes (lncRNAs) como reguladores críticos da manutenção das GSCs e possíveis alvos terapêuticos. Usando uma abordagem computacional integrativa, iremos analisar dados de sequenciamento de RNA de célula única (scRNA-seq) de mais de 17.000 células tumorais para: (1) mapear trajetórias de diferenciação e identificar lncRNAs associados ao fenótipo tronco-tumoral ("stemness"); (2) construir redes de co-expressão gênica para descobrir módulos funcionais de lncRNAs; (3) caracterizar interações ligante-receptor mediadas por lncRNAs; e (4) distinguir assinaturas de lncRNAs conservadas e específicas de gliomas IDHmut e IDHwt. A expressão dos lncRNAs candidatos será avaliada em dados de "bulk" RNAseq para avaliar seu valor prognóstico. Ao decifrar as redes regulatórias de lncRNAs nas GSCs, este estudo visa identificar novos alvos terapêuticos para superar a resistência ao tratamento em gliomas. Esses achados podem contribuir para o desenvolvimento de novas estratégias na área da oncologia de precisão, com potenciais aplicações translacionais em outros cânceres agressivos e quimiorresistentes.