Testando os limites específicos e geográficos de Ceratophrys aurita e Ceratophrys joazeirensis usando métodos de sequenciamento massivo

• Processo: 25/05468-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 30 de setembro de 2025
• Data de Término da vigência: 29 de maio de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia
• Pesquisador responsável: Célio Fernando Baptista Haddad
• Beneficiário: Diego Bueno Villafañe
• Supervisor: Arley Camargo Bentaberry
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Universidad De La República, Sede Rivera, Uruguai
• Vinculado à bolsa: 23/08932-1 - Diversificação e história evolutiva dos sapos-de-chifre Ceratophrys aurita (Raddi, 1823), Ceratophrys cranwelli Barrio 1980, Ceratophrys joazeirensis Mercadal e Barrio, 1986 e Ceratophrys ornata (Bell, 1843) (Anura, Ceratophryidae), BP.DR
• Assunto(s): Anura Ceratophryidae Região neotropical
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Anura | Biogeografia evolutiva | Ceratophryidae | ddRADSeq | Região Neotropical | Biologia evolutiva, filogeografia e genômica populacional

Resumo

O gênero Ceratophrys (Anura: Ceratophryidae) inclui anfíbios anuros terrestres com características morfológicas únicas e ampla distribuição na América do Sul. As espécies Ceratophrys aurita e C. joazeirensis, distribuídas na Mata Atlântica e na Caatinga, respectivamente, apresentam desafios taxonômicos devido à morfologia semelhante e à baixa diferenciação genética. Embora estudos anteriores tenham confirmado a monofilia do clado C. aurita + C. joazeirensis, limitações na amostragem e na capacidade de resolução dos marcadores genéticos empregados dificultam uma compreensão detalhada de suas histórias evolutivas. Até o momento, nossos resultados inéditos, obtidos a partir da maior amostragem geográfica realizada para essas espécies, revelaram baixo suporte nos ramos basais dos clados de ambas as espécies, especialmente em C. aurita. Essas evidências sugerem uma história evolutiva mais complexa do que se estimava anteriormente, levantando hipóteses sobre possíveis cenários de divergência recente, hibridização ou eventos de introgressão. Esses indícios destacam a necessidade de uma reavaliação exaustiva para abordar as questões taxonômicas e evolutivas pendentes.Nesse contexto, este projeto tem como objetivo reavaliar os limites específicos entre C. aurita e C. joazeirensis, definir seu status taxonômico e investigar os eventos evolutivos que moldaram sua diversificação. Para isso, será utilizada a maior amostragem geográfica obtida até o momento para ambas as espécies, juntamente com dados genômicos de alta resolução gerados pelo método ddRADseq. Esse método permite acessar milhares de SNPs, marcadores ideais para examinar tanto divergências superficiais quanto profundas, oferecendo uma base robusta para testar a existência de entidades taxonômicas distintas e explorar as interações evolutivas desde sua divergência.Além disso, o projeto investigará aspectos cruciais da estrutura genética populacional, como fluxo gênico histórico e contemporâneo, potenciais eventos de hibridização e introgressão, bem como dinâmicas demográficas associadas a mudanças paleogeográficas e climáticas nas regiões da Mata Atlântica e da Caatinga. A correta delimitação de C. aurita e C. joazeirensis não apenas contribuirá para entender melhor suas biologias e evolução, mas também estabelecerá bases mais sólidas para futuras pesquisas e estratégias de conservação mais bem fundamentadas. Este trabalho é particularmente relevante, pois se sabe pouco sobre ambas as espécies, incluindo aspectos básicos de sua história natural, distribuição geográfica e até mesmo seus estados de conservação.O trabalho consistirá na extração de DNA das amostras já disponíveis, seguida do treinamento e desenvolvimento do protocolo para a preparação de bibliotecas por meio da técnica ddRADseq, que será utilizada para o sequenciamento de nova geração na plataforma Illumina. Além disso, serei treinado para processar os dados brutos de sequenciamento e gerar matrizes de dados de SNP, utilizando as ferramentas bioinformáticas necessárias para atender aos objetivos do projeto. O Laboratório de Biogeografia e Evolução (Universidade da República, Rivera, Uruguai) está totalmente equipado para realizar essas atividades e conta com uma equipe altamente capacitada e familiarizada com os protocolos necessários. O Dr. Arley Camargo Bentaberry, referência regional em métodos de ddRADseq, supervisionará o processo e contribuirá com sua ampla experiência na implementação e otimização dessas técnicas. (AU)