Investigação sobre o papel do retrotransposon TNT1 em redes de regulação gênica em tabaco

• Processo: 09/50630-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2009
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2012
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Marie-Anne Van Sluys
• Beneficiário: Érika Maria de Jesus
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Elementos de DNA transponíveis Retroelementos Regulação da expressão gênica Tabaco Inativação gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Microarray De Tabaco | Regulacao Genica | Retrotransposon | Tnt1

Resumo

Os Elementos de Transposição (TEs) são sequências genéticas móveis, cuja atividade pode ser altamente mutagênica. Isto levou os genomas hospedeiros a desenvolver mecanismos de silenciamento dos TEs, de modo a manter a viabilidade frente à sua presença. Retrotransposons da superfamília Tnt1 estão presentes no genoma de solanáceas em centenas de cópias, e se ativam quando a planta se encontra sob diferentes condições de estresse. Logo, a presença de diversas cópias do elemento, juntamente com o fato de que sua atividade está regulada e que o mesmo pode expressar-se fortemente em situações específicas, fazem destes potenciais peças-chave na formação de uma rede de regulação coordenada de um conjunto determinado de genes. Em experimentos de silenciamento de Tnt1, obtivemos plantas de tabaco com lesões necróticas nas folhas e atraso no desenvolvimento de folhas e raízes. Estes resultados sugerem um papel biológico destes retrotransposons em processos de defesa ou resposta a estresse, bem como em processos relacionados a desenvolvimento. A atualidade e crescente relevância de dados a respeito da co-evolução entre TEs e genomas, de modo a elucidar processos pelos quais estes elementos geram impacto sobre seus genomas hospedeiros, justifica um aprofundamento nestas investigações. O presente projeto propõe analisar um possível papel biológico do retrotransposon Tnt1 em redes de regulação gênica em tabaco. Serão comparados perfis de expressão em plantas contendo uma construção que induz o silenciamento de Tnt1 e seus controles, de modo a identificar genes que se expressem diferencialmente nos dois casos. (AU)