Determinação da biodiversidade de foraminíferos recentes da Enseada do Flamengo (Ubatuba, SP) através da utilização de ferramentas biomoleculares

• Processo: 09/13666-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2009
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2012
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Oceanografia - Oceanografia Biológica
• Pesquisador responsável: Vivian Helena Pellizari
• Beneficiário: André Rosch Rodrigues
• Instituição Sede: Instituto Oceanográfico (IO). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Foraminifera Biodiversidade
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biodiversidade marinha | Bioindicadores ambientais | Ecologia Costeira | Foraminíferos | Variáveis ecológicas | Ecologia molecular de microrganismos

Resumo

O presente projeto pretende determinar a biodiversidade de foraminíferos na Enseada do Flamengo (Ubatuba, SP) com auxílio de ferramentas biomoleculares e, através da relação da riqueza e diversidade de espécies determinadas pela biologia molecular e análises multivariadas com parâmetros ambientais, comparar e relacionar os resultados obtidos com a determinação de associações de foraminíferos recentes com a utilização da técnica clássica, amplamente utilizada em estudos com distribuição de foraminíferos recente e sub-recentes, para abordagens ecológicas, oceanográficas e micropaleontológicas. A partir de 33 amostras de sedimento coletadas Enseada do Flamengo será analisada a fauna de foraminíferos e determinadas algumas variáveis abióticas do meio bem como granulometria. As amostras para análise de foraminíferos pelo método clássico irão indicar abundância de espécimes, riqueza e alguns índices ecológicos tanto para a fauna viva (testas coradas com Rosa de Bengala), como para a morta (testas não coradas). As análises biomoleculares serão realizadas em seis amostras, onde será determinado riqueza e diversidade de foraminíferos através de DNA extraído e a realização de análise de PCR com primers espécies-específicos para foraminíferos e sequenciamento do material resultante. Análises de correlação entre os dados obtidos nas duas abordagens (clássica e biomolecular) serão realizados com valores de riqueza e índices ecológicos. Análises multivariadas como PCA e MDS serão realizadas com os resultados obtidos nas duas abordagens e também servirão como parâmetro comparativo.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

RODRIGUES, ANDRE ROSCH; PELLIZARI, VIVIAN HELENA; ALMEIDA, CRISTIANO DE SALLES; DE SOUSA, EDUINETTY CECI P. M.; HOLZMANN, MARIA; PAWLOWSKI, JAN. New phylotypes of foraminifera in subtropical Brazilian coastal waters revealed by environmental DNA metabarcoding. JOURNAL OF SEDIMENTARY ENVIRONMENTS, v. 6, n. 1, p. 11-pg., 2021-02-04. (09/10842-3, 09/13666-1)

DIAZ, TERESA LIMA; RODRIGUES, ANDRE ROSCH; EICHLER, BEATRIZ BECK. DISTRIBUTION OF FORAMINIFERA IN A SUBTROPICAL BRAZILIAN ESTUARINE SYSTEM. JOURNAL OF FORAMINIFERAL RESEARCH, v. 44, n. 2, p. 90-108, APR 2014. (09/13666-1)

RODRIGUES, ANDRE ROSCH; PELLIZARI, VIVIAN HELENA; ALMEIDA, CRISTIANO DE SALLES; DE SOUSA, EDUINETTY CECI P. M.; HOLZMANN, MARIA; PAWLOWSKI, JAN. New phylotypes of foraminifera in subtropical Brazilian coastal waters revealed by environmental DNA metabarcoding. JOURNAL OF SEDIMENTARY ENVIRONMENTS, v. 6, n. 1, FEB 2021. (09/10842-3, 09/13666-1)