Teoria do funcional da densidade aplicada a compostos do tipo 2-tiopi ridina com cisteino-proteases.

• Processo: 09/52189-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2009
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Julio Ricardo Sambrano
• Beneficiário: Camila Ramalho Bonturi
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências (FC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Bauru. Bauru , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 06/56078-4 - Estudos estruturais, de docking e de dinâmica molecular aplicados à inibição enzimática de cisteíno proteases por organocalcogênicos, AP.JP
• Assunto(s): Catepsina B Simulação de acoplamento molecular Telúrio Modelagem molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Catepsina B | Docking | Modelagem Molecular | Telurio

Resumo

O projeto visa na construção e no estudo dos complexos moleculares da catepsina B (CatB) com uma série de quatro compostos do tipo diclorodiorgano Te(IV) (TeC12R2). Estes trabalhos serão realizados em paralelo utilizando duas estruturas cristalográfícas de CatB, as quais apresentam diferenças conformacionais, totalizando assim 8 pares de complexos proteína-ligante a serem estudados. O interesse na inibição da CatB está baseado no fato da sua sobre atividade ter sido associada com doenças como por exemplo, distrofia muscular, artrite reumática, metástase tumoral e osteoporose. A função inibidora dos compostos orgânicos de Te sugerida é através da formação de uma ligação covalente entre o Te e o grupo tiolato da cisteíno-protease. Os estudos de modelagem dos complexos serão realizados mediante métodos computacionais de docking. A estrutura dos ligantes será previamente submetida a uma otimização de geometria por métodos químico-quânticos com o fim de homogeneizar a qualidade da simulação. Neste caso, conta-se com a estrutura cristalográfica dos quatro ligantes, mas, novos ligantes modelados teoricamente podem ser incluídos em trabalhos posteriores. O estudo desses complexos (CatB-TeCI2R2) poderá fornecer maior entendimento a respeito dos mecanismos de ligação; a capacidade de inibição espera-se que esteja associada com o posicionamento favorável do Te do ligante em relação ao S da cisteína catalítica nos complexos precursores construídos teoricamente neste projeto. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

ANGEL VEGA-TEIJIDO, MAURICIO; MALUF, SARAH EL CHAMY; BONTURI, CAMILA RAMALHO; SAMBRANO, JULIO RICARDO; VENTURA, OSCAR N.. Theoretical insight into the mechanism for the inhibition of the cysteine protease cathepsin B by 1,2,4-thiadiazole derivatives. Journal of Molecular Modeling, v. 20, n. 6, JUN 2014. (09/52189-4, 09/52188-8)